Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWE0

LRSAM1, E3 ubiquitin-protein ligase LRSAM1, humanhuman

Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRSAM1Q6UWE0 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRSAM1Q6UWE0 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRSAM1Q6UWE0 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRSAM1Q6UWE0 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRSAM1Q6UWE0 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRSAM1Q6UWE0 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRSAM1Q6UWE0 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRSAM1Q6UWE0 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRSAM1Q6UWE0 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRSAM1Q6UWE0 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRSAM1Q6UWE0 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRSAM1Q6UWE0 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRSAM1Q6UWE0 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRSAM1Q6UWE0 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRSAM1Q6UWE0 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRSAM1Q6UWE0 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
LRSAM1Q6UWE0 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRSAM1Q6UWE0 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRSAM1Q6UWE0 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRSAM1Q6UWE0 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRSAM1Q6UWE0 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRSAM1Q6UWE0 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRSAM1Q6UWE0 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRSAM1Q6UWE0 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRSAM1Q6UWE0 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
LRSAM1Q6UWE0 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LRSAM1Q6UWE0 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LRSAM1Q6UWE0 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LRSAM1Q6UWE0 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LRSAM1Q6UWE0 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LRSAM1Q6UWE0 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LRSAM1Q6UWE0 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRSAM1Q6UWE0 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRSAM1Q6UWE0 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRSAM1Q6UWE0 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRSAM1Q6UWE0 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRSAM1Q6UWE0 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRSAM1Q6UWE0 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRSAM1Q6UWE0 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRSAM1Q6UWE0 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRSAM1Q6UWE0 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRSAM1Q6UWE0 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRSAM1Q6UWE0 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRSAM1Q6UWE0 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRSAM1Q6UWE0 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRSAM1Q6UWE0 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRSAM1Q6UWE0 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRSAM1Q6UWE0 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRSAM1Q6UWE0 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRSAM1Q6UWE0 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRSAM1Q6UWE0 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
LRSAM1Q6UWE0 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRSAM1Q6UWE0 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRSAM1Q6UWE0 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRSAM1Q6UWE0 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LRSAM1Q6UWE0 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LRSAM1Q6UWE0 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LRSAM1Q6UWE0 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LRSAM1Q6UWE0 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LRSAM1Q6UWE0 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LRSAM1Q6UWE0 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LRSAM1Q6UWE0 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LRSAM1Q6UWE0 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LRSAM1Q6UWE0 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRSAM1Q6UWE0 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRSAM1Q6UWE0 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRSAM1Q6UWE0 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRSAM1Q6UWE0 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRSAM1Q6UWE0 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRSAM1Q6UWE0 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRSAM1Q6UWE0 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRSAM1Q6UWE0 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRSAM1Q6UWE0 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LRSAM1Q6UWE0 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LRSAM1Q6UWE0 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LRSAM1Q6UWE0 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LRSAM1Q6UWE0 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LRSAM1Q6UWE0 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LRSAM1Q6UWE0 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LRSAM1Q6UWE0 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
LRSAM1Q6UWE0 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LRSAM1Q6UWE0 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LRSAM1Q6UWE0 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LRSAM1Q6UWE0 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LRSAM1Q6UWE0 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LRSAM1Q6UWE0 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LRSAM1Q6UWE0 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
LRSAM1Q6UWE0 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
LRSAM1Q6UWE0 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
LRSAM1Q6UWE0 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
LRSAM1Q6UWE0 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
LRSAM1Q6UWE0 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
LRSAM1Q6UWE0 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
LRSAM1Q6UWE0 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
LRSAM1Q6UWE0 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
LRSAM1Q6UWE0 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
LRSAM1Q6UWE0 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
LRSAM1Q6UWE0 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
LRSAM1Q6UWE0 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
LRSAM1Q6UWE0 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 170.2 ms