Protein–RNA interactions for Protein: Q14515

SPARCL1, SPARC-like protein 1, humanhuman

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Length 664 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPARCL1Q14515 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SPARCL1Q14515 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SPARCL1Q14515 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SPARCL1Q14515 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SPARCL1Q14515 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SPARCL1Q14515 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SPARCL1Q14515 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SPARCL1Q14515 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SPARCL1Q14515 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SPARCL1Q14515 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SPARCL1Q14515 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SPARCL1Q14515 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SPARCL1Q14515 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SPARCL1Q14515 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SPARCL1Q14515 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SPARCL1Q14515 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPARCL1Q14515 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SPARCL1Q14515 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPARCL1Q14515 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPARCL1Q14515 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPARCL1Q14515 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPARCL1Q14515 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPARCL1Q14515 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPARCL1Q14515 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPARCL1Q14515 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPARCL1Q14515 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPARCL1Q14515 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPARCL1Q14515 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPARCL1Q14515 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPARCL1Q14515 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPARCL1Q14515 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPARCL1Q14515 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPARCL1Q14515 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPARCL1Q14515 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPARCL1Q14515 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPARCL1Q14515 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPARCL1Q14515 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPARCL1Q14515 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPARCL1Q14515 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPARCL1Q14515 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPARCL1Q14515 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPARCL1Q14515 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPARCL1Q14515 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPARCL1Q14515 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPARCL1Q14515 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPARCL1Q14515 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPARCL1Q14515 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SPARCL1Q14515 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SPARCL1Q14515 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SPARCL1Q14515 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SPARCL1Q14515 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPARCL1Q14515 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPARCL1Q14515 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPARCL1Q14515 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPARCL1Q14515 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPARCL1Q14515 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPARCL1Q14515 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPARCL1Q14515 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPARCL1Q14515 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPARCL1Q14515 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPARCL1Q14515 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPARCL1Q14515 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPARCL1Q14515 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SPARCL1Q14515 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SPARCL1Q14515 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SPARCL1Q14515 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SPARCL1Q14515 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPARCL1Q14515 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPARCL1Q14515 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPARCL1Q14515 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPARCL1Q14515 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPARCL1Q14515 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPARCL1Q14515 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPARCL1Q14515 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPARCL1Q14515 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPARCL1Q14515 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPARCL1Q14515 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPARCL1Q14515 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPARCL1Q14515 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPARCL1Q14515 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPARCL1Q14515 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPARCL1Q14515 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPARCL1Q14515 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPARCL1Q14515 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPARCL1Q14515 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPARCL1Q14515 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SPARCL1Q14515 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SPARCL1Q14515 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPARCL1Q14515 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPARCL1Q14515 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPARCL1Q14515 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPARCL1Q14515 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPARCL1Q14515 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPARCL1Q14515 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPARCL1Q14515 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPARCL1Q14515 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPARCL1Q14515 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPARCL1Q14515 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPARCL1Q14515 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPARCL1Q14515 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
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