Protein–RNA interactions for Protein: Q14112

NID2, Nidogen-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NID2Q14112 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NID2Q14112 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NID2Q14112 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NID2Q14112 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NID2Q14112 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NID2Q14112 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NID2Q14112 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NID2Q14112 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NID2Q14112 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NID2Q14112 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NID2Q14112 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NID2Q14112 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NID2Q14112 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NID2Q14112 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NID2Q14112 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
NID2Q14112 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NID2Q14112 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NID2Q14112 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NID2Q14112 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NID2Q14112 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NID2Q14112 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NID2Q14112 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
NID2Q14112 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NID2Q14112 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NID2Q14112 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NID2Q14112 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NID2Q14112 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NID2Q14112 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NID2Q14112 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NID2Q14112 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NID2Q14112 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NID2Q14112 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NID2Q14112 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NID2Q14112 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NID2Q14112 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NID2Q14112 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NID2Q14112 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NID2Q14112 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NID2Q14112 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NID2Q14112 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
NID2Q14112 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NID2Q14112 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NID2Q14112 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NID2Q14112 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NID2Q14112 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NID2Q14112 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NID2Q14112 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NID2Q14112 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NID2Q14112 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NID2Q14112 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NID2Q14112 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NID2Q14112 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NID2Q14112 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NID2Q14112 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
NID2Q14112 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NID2Q14112 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NID2Q14112 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NID2Q14112 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NID2Q14112 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NID2Q14112 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NID2Q14112 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NID2Q14112 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NID2Q14112 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NID2Q14112 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NID2Q14112 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NID2Q14112 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NID2Q14112 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NID2Q14112 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NID2Q14112 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NID2Q14112 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NID2Q14112 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NID2Q14112 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NID2Q14112 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
NID2Q14112 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NID2Q14112 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NID2Q14112 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NID2Q14112 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NID2Q14112 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NID2Q14112 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NID2Q14112 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NID2Q14112 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NID2Q14112 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
NID2Q14112 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
NID2Q14112 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
NID2Q14112 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
NID2Q14112 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
NID2Q14112 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
NID2Q14112 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.63
NID2Q14112 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NID2Q14112 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NID2Q14112 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NID2Q14112 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
NID2Q14112 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NID2Q14112 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NID2Q14112 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NID2Q14112 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NID2Q14112 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NID2Q14112 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
NID2Q14112 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NID2Q14112 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
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