Protein–RNA interactions for Protein: Q13114

TRAF3, TNF receptor-associated factor 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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TRAF3Q13114 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TRAF3Q13114 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
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TRAF3Q13114 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRAF3Q13114 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRAF3Q13114 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRAF3Q13114 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
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TRAF3Q13114 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRAF3Q13114 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
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TRAF3Q13114 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRAF3Q13114 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRAF3Q13114 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRAF3Q13114 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRAF3Q13114 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
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TRAF3Q13114 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRAF3Q13114 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRAF3Q13114 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRAF3Q13114 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
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TRAF3Q13114 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
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TRAF3Q13114 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRAF3Q13114 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRAF3Q13114 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRAF3Q13114 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
TRAF3Q13114 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRAF3Q13114 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms