Protein–RNA interactions for Protein: Q12267

SMC4, Structural maintenance of chromosomes protein 4, yeast

Predictions only

Length 1,418 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SMC4	Q12267	snR70	snR70	164 nt		4.37	□□□□□ -1.71
SMC4	Q12267	DAL2	YIR029W	1032 nt		4.37	□□□□□ -1.71
SMC4	Q12267	AIM25	YJR100C	984 nt		4.37	□□□□□ -1.71
SMC4	Q12267	JJJ1	YNL227C	1773 nt		4.36	□□□□□ -1.71
SMC4	Q12267	FRE1	YLR214W	2061 nt		4.36	□□□□□ -1.71
SMC4	Q12267	MSN2	YMR037C	2115 nt		4.36	□□□□□ -1.71
SMC4	Q12267	MAK32	YCR019W	1092 nt		4.36	□□□□□ -1.71
SMC4	Q12267	TOS8	YGL096W	831 nt		4.36	□□□□□ -1.71
SMC4	Q12267	LNP1	YHR192W	837 nt		4.36	□□□□□ -1.71
SMC4	Q12267	PAU17	YLL025W	375 nt		4.36	□□□□□ -1.71
SMC4	Q12267	TUM1	YOR251C	915 nt		4.36	□□□□□ -1.71
SMC4	Q12267	YLR352W	YLR352W	2424 nt		4.36	□□□□□ -1.71
SMC4	Q12267	CSR2	YPR030W	3366 nt		4.35	□□□□□ -1.71
SMC4	Q12267	BUD5	YCR038C	1929 nt		4.35	□□□□□ -1.71
SMC4	Q12267	RBA50	YDR527W	1320 nt		4.35	□□□□□ -1.71
SMC4	Q12267	ATG21	YPL100W	1491 nt		4.35	□□□□□ -1.71
SMC4	Q12267	YHR078W	YHR078W	1659 nt		4.35	□□□□□ -1.71
SMC4	Q12267	ATP5	YDR298C	639 nt		4.34	□□□□□ -1.71
SMC4	Q12267	YOR283W	YOR283W	693 nt		4.34	□□□□□ -1.71
SMC4	Q12267	SIN3	YOL004W	4611 nt		4.34	□□□□□ -1.71
SMC4	Q12267	YOL019W	YOL019W	1656 nt		4.34	□□□□□ -1.71
SMC4	Q12267	KRI1	YNL308C	1776 nt		4.34	□□□□□ -1.71
SMC4	Q12267	RPB9	YGL070C	369 nt		4.33	□□□□□ -1.72
SMC4	Q12267	PEX18	YHR160C	852 nt		4.33	□□□□□ -1.72
SMC4	Q12267	ATG27	YJL178C	816 nt		4.33	□□□□□ -1.72
SMC4	Q12267	STU1	YBL034C	4542 nt		4.33	□□□□□ -1.72
SMC4	Q12267	WSS1	YHR134W	810 nt		4.32	□□□□□ -1.72
SMC4	Q12267	THP2	YHR167W	786 nt		4.32	□□□□□ -1.72
SMC4	Q12267	RPL6A	YML073C	531 nt		4.32	□□□□□ -1.72
SMC4	Q12267	YFL040W	YFL040W	1623 nt		4.32	□□□□□ -1.72
SMC4	Q12267	PTP3	YER075C	2787 nt		4.32	□□□□□ -1.72
SMC4	Q12267	SDH3	YKL141W	597 nt		4.31	□□□□□ -1.72
SMC4	Q12267	RPL23A	YBL087C	414 nt		4.31	□□□□□ -1.72
SMC4	Q12267	ROK1	YGL171W	1695 nt		4.31	□□□□□ -1.72
SMC4	Q12267	FZO1	YBR179C	2568 nt		4.31	□□□□□ -1.72
SMC4	Q12267	RAX2	YLR084C	3663 nt		4.31	□□□□□ -1.72
SMC4	Q12267	APL6	YGR261C	2430 nt		4.3	□□□□□ -1.72
SMC4	Q12267	YLR278C	YLR278C	4026 nt		4.3	□□□□□ -1.72
SMC4	Q12267	SDS23	YGL056C	1584 nt		4.3	□□□□□ -1.72
SMC4	Q12267	RPS13	YDR064W	456 nt		4.29	□□□□□ -1.72
SMC4	Q12267	MPC3	YGR243W	441 nt		4.29	□□□□□ -1.72
SMC4	Q12267	YOL107W	YOL107W	1029 nt		4.29	□□□□□ -1.72
SMC4	Q12267	AYT1	YLL063C	1425 nt		4.29	□□□□□ -1.72
SMC4	Q12267	PMS1	YNL082W	2622 nt		4.29	□□□□□ -1.72
SMC4	Q12267	HPC2	YBR215W	1878 nt		4.29	□□□□□ -1.72
SMC4	Q12267	LCL2	YLR104W	396 nt		4.29	□□□□□ -1.72
SMC4	Q12267	MRPL37	YBR268W	318 nt		4.28	□□□□□ -1.72
SMC4	Q12267	RRP5	YMR229C	5190 nt		4.27	□□□□□ -1.73
SMC4	Q12267	RSM24	YDR175C	960 nt		4.27	□□□□□ -1.73
SMC4	Q12267	GYP7	YDL234C	2241 nt		4.26	□□□□□ -1.73
SMC4	Q12267	DCV1	YFR012W	609 nt		4.26	□□□□□ -1.73
SMC4	Q12267	YJR037W	YJR037W	384 nt		4.26	□□□□□ -1.73
SMC4	Q12267	YOR300W	YOR300W	309 nt		4.26	□□□□□ -1.73
SMC4	Q12267	RPL33A	YPL143W	324 nt		4.26	□□□□□ -1.73
SMC4	Q12267	RPO26	YPR187W	468 nt		4.26	□□□□□ -1.73
SMC4	Q12267	TCO89	YPL180W	2400 nt		4.26	□□□□□ -1.73
SMC4	Q12267	MDM38	YOL027C	1722 nt		4.25	□□□□□ -1.73
SMC4	Q12267	YHR052W-A	YHR052W-A	195 nt		4.25	□□□□□ -1.73
SMC4	Q12267	YHR054W-A	YHR054W-A	195 nt		4.25	□□□□□ -1.73
SMC4	Q12267	NEW1	YPL226W	3591 nt		4.24	□□□□□ -1.73
SMC4	Q12267	CDC6	YJL194W	1542 nt		4.24	□□□□□ -1.73
SMC4	Q12267	PET54	YGR222W	882 nt		4.24	□□□□□ -1.73
SMC4	Q12267	tW(CCA)G1	tW(CCA)G1	72 nt		4.24	□□□□□ -1.73
SMC4	Q12267	tW(CCA)G2	tW(CCA)G2	72 nt		4.24	□□□□□ -1.73
SMC4	Q12267	tW(CCA)J	tW(CCA)J	72 nt		4.24	□□□□□ -1.73
SMC4	Q12267	tW(CCA)K	tW(CCA)K	72 nt		4.24	□□□□□ -1.73
SMC4	Q12267	tW(CCA)M	tW(CCA)M	72 nt		4.24	□□□□□ -1.73
SMC4	Q12267	tW(CCA)P	tW(CCA)P	72 nt		4.24	□□□□□ -1.73
SMC4	Q12267	YKL107W	YKL107W	930 nt		4.24	□□□□□ -1.73
SMC4	Q12267	JIP3	YLR331C	378 nt		4.24	□□□□□ -1.73
SMC4	Q12267	YDR186C	YDR186C	2634 nt		4.24	□□□□□ -1.73
SMC4	Q12267	YRM1	YOR172W	2361 nt		4.24	□□□□□ -1.73
SMC4	Q12267	PEX1	YKL197C	3132 nt		4.23	□□□□□ -1.73
SMC4	Q12267	AST2	YER101C	1293 nt		4.23	□□□□□ -1.73
SMC4	Q12267	CAP2	YIL034C	864 nt		4.23	□□□□□ -1.73
SMC4	Q12267	SFH1	YLR321C	1281 nt		4.23	□□□□□ -1.73
SMC4	Q12267	YBR298C-A	YBR298C-A	222 nt		4.23	□□□□□ -1.73
SMC4	Q12267	APM4	YOL062C	1476 nt		4.23	□□□□□ -1.73
SMC4	Q12267	GCD1	YOR260W	1737 nt		4.23	□□□□□ -1.73
SMC4	Q12267	YDR464C-A	YDR464C-A	189 nt		4.22	□□□□□ -1.73
SMC4	Q12267	YHR032W-A	YHR032W-A	180 nt		4.22	□□□□□ -1.73
SMC4	Q12267	SPO16	YHR153C	597 nt		4.22	□□□□□ -1.73
SMC4	Q12267	YAP5	YIR018W	738 nt		4.22	□□□□□ -1.73
SMC4	Q12267	CCW14	YLR390W-A	717 nt		4.22	□□□□□ -1.73
SMC4	Q12267	YOR186W	YOR186W	435 nt		4.22	□□□□□ -1.73
SMC4	Q12267	RFM1	YOR279C	933 nt		4.22	□□□□□ -1.73
SMC4	Q12267	XRN1	YGL173C	4587 nt		4.22	□□□□□ -1.73
SMC4	Q12267	PRP22	YER013W	3438 nt		4.22	□□□□□ -1.73
SMC4	Q12267	PDR1	YGL013C	3207 nt		4.22	□□□□□ -1.73
SMC4	Q12267	RTA1	YGR213C	954 nt		4.21	□□□□□ -1.73
SMC4	Q12267	BCK1	YJL095W	4437 nt		4.21	□□□□□ -1.74
SMC4	Q12267	GIN4	YDR507C	3429 nt		4.21	□□□□□ -1.74
SMC4	Q12267	NSP1	YJL041W	2472 nt		4.21	□□□□□ -1.74
SMC4	Q12267	YFL065C	YFL065C	309 nt		4.21	□□□□□ -1.74
SMC4	Q12267	CDC11	YJR076C	1248 nt		4.21	□□□□□ -1.74
SMC4	Q12267	TIS11	YLR136C	858 nt		4.21	□□□□□ -1.74
SMC4	Q12267	HFA1	YMR207C	6372 nt		4.21	□□□□□ -1.74
SMC4	Q12267	OM14	YBR230C	405 nt		4.21	□□□□□ -1.74
SMC4	Q12267	KRE5	YOR336W	4098 nt		4.2	□□□□□ -1.74
SMC4	Q12267	UBC1	YDR177W	648 nt		4.2	□□□□□ -1.74

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