Protein–RNA interactions for Protein: Q02962

PAX2, Paired box protein Pax-2, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX2Q02962 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PAX2Q02962 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PAX2Q02962 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PAX2Q02962 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PAX2Q02962 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PAX2Q02962 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PAX2Q02962 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PAX2Q02962 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PAX2Q02962 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PAX2Q02962 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PAX2Q02962 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PAX2Q02962 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PAX2Q02962 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PAX2Q02962 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PAX2Q02962 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PAX2Q02962 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PAX2Q02962 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PAX2Q02962 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PAX2Q02962 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PAX2Q02962 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PAX2Q02962 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PAX2Q02962 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PAX2Q02962 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PAX2Q02962 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PAX2Q02962 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PAX2Q02962 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PAX2Q02962 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PAX2Q02962 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PAX2Q02962 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PAX2Q02962 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PAX2Q02962 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PAX2Q02962 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PAX2Q02962 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PAX2Q02962 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PAX2Q02962 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PAX2Q02962 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PAX2Q02962 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PAX2Q02962 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PAX2Q02962 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PAX2Q02962 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PAX2Q02962 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PAX2Q02962 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PAX2Q02962 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PAX2Q02962 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PAX2Q02962 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PAX2Q02962 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PAX2Q02962 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PAX2Q02962 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PAX2Q02962 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PAX2Q02962 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
PAX2Q02962 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PAX2Q02962 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PAX2Q02962 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PAX2Q02962 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PAX2Q02962 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PAX2Q02962 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PAX2Q02962 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
PAX2Q02962 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PAX2Q02962 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PAX2Q02962 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PAX2Q02962 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PAX2Q02962 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PAX2Q02962 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
PAX2Q02962 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PAX2Q02962 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PAX2Q02962 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PAX2Q02962 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PAX2Q02962 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PAX2Q02962 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PAX2Q02962 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PAX2Q02962 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PAX2Q02962 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PAX2Q02962 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PAX2Q02962 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PAX2Q02962 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PAX2Q02962 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PAX2Q02962 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PAX2Q02962 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PAX2Q02962 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PAX2Q02962 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PAX2Q02962 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PAX2Q02962 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PAX2Q02962 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PAX2Q02962 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PAX2Q02962 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PAX2Q02962 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PAX2Q02962 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PAX2Q02962 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PAX2Q02962 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
PAX2Q02962 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PAX2Q02962 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PAX2Q02962 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PAX2Q02962 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PAX2Q02962 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PAX2Q02962 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PAX2Q02962 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PAX2Q02962 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PAX2Q02962 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PAX2Q02962 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PAX2Q02962 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms