Protein–RNA interactions for Protein: Q01064

PDE1B, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1B, humanhuman

Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE1BQ01064 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDE1BQ01064 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDE1BQ01064 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDE1BQ01064 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDE1BQ01064 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PDE1BQ01064 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDE1BQ01064 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDE1BQ01064 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDE1BQ01064 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDE1BQ01064 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDE1BQ01064 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDE1BQ01064 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDE1BQ01064 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDE1BQ01064 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDE1BQ01064 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDE1BQ01064 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDE1BQ01064 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PDE1BQ01064 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
PDE1BQ01064 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDE1BQ01064 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDE1BQ01064 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDE1BQ01064 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDE1BQ01064 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PDE1BQ01064 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PDE1BQ01064 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PDE1BQ01064 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PDE1BQ01064 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PDE1BQ01064 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDE1BQ01064 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDE1BQ01064 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDE1BQ01064 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDE1BQ01064 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDE1BQ01064 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDE1BQ01064 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDE1BQ01064 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDE1BQ01064 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDE1BQ01064 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PDE1BQ01064 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDE1BQ01064 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDE1BQ01064 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDE1BQ01064 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDE1BQ01064 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PDE1BQ01064 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PDE1BQ01064 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDE1BQ01064 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDE1BQ01064 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDE1BQ01064 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDE1BQ01064 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDE1BQ01064 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDE1BQ01064 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDE1BQ01064 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDE1BQ01064 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDE1BQ01064 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDE1BQ01064 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDE1BQ01064 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDE1BQ01064 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDE1BQ01064 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDE1BQ01064 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDE1BQ01064 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDE1BQ01064 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDE1BQ01064 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDE1BQ01064 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDE1BQ01064 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDE1BQ01064 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PDE1BQ01064 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDE1BQ01064 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDE1BQ01064 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDE1BQ01064 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDE1BQ01064 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PDE1BQ01064 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDE1BQ01064 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDE1BQ01064 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDE1BQ01064 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PDE1BQ01064 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDE1BQ01064 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDE1BQ01064 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDE1BQ01064 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PDE1BQ01064 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDE1BQ01064 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDE1BQ01064 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PDE1BQ01064 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDE1BQ01064 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDE1BQ01064 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDE1BQ01064 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDE1BQ01064 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDE1BQ01064 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDE1BQ01064 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDE1BQ01064 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDE1BQ01064 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDE1BQ01064 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDE1BQ01064 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDE1BQ01064 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDE1BQ01064 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDE1BQ01064 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDE1BQ01064 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDE1BQ01064 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDE1BQ01064 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PDE1BQ01064 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDE1BQ01064 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDE1BQ01064 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.1 ms