Protein–RNA interactions for Protein: P48304

REG1B, Lithostathine-1-beta, humanhuman

Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REG1BP48304 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
REG1BP48304 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
REG1BP48304 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
REG1BP48304 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
REG1BP48304 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
REG1BP48304 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
REG1BP48304 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
REG1BP48304 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
REG1BP48304 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
REG1BP48304 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
REG1BP48304 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
REG1BP48304 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
REG1BP48304 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
REG1BP48304 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
REG1BP48304 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
REG1BP48304 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
REG1BP48304 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
REG1BP48304 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
REG1BP48304 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
REG1BP48304 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
REG1BP48304 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
REG1BP48304 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
REG1BP48304 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
REG1BP48304 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
REG1BP48304 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
REG1BP48304 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
REG1BP48304 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
REG1BP48304 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
REG1BP48304 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
REG1BP48304 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
REG1BP48304 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
REG1BP48304 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
REG1BP48304 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
REG1BP48304 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
REG1BP48304 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
REG1BP48304 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
REG1BP48304 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
REG1BP48304 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
REG1BP48304 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
REG1BP48304 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
REG1BP48304 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
REG1BP48304 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
REG1BP48304 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
REG1BP48304 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
REG1BP48304 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
REG1BP48304 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
REG1BP48304 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
REG1BP48304 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
REG1BP48304 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
REG1BP48304 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
REG1BP48304 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
REG1BP48304 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
REG1BP48304 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
REG1BP48304 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
REG1BP48304 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
REG1BP48304 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
REG1BP48304 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
REG1BP48304 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
REG1BP48304 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
REG1BP48304 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
REG1BP48304 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
REG1BP48304 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
REG1BP48304 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
REG1BP48304 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
REG1BP48304 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
REG1BP48304 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
REG1BP48304 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
REG1BP48304 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
REG1BP48304 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
REG1BP48304 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
REG1BP48304 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
REG1BP48304 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
REG1BP48304 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
REG1BP48304 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
REG1BP48304 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
REG1BP48304 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
REG1BP48304 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
REG1BP48304 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
REG1BP48304 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
REG1BP48304 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
REG1BP48304 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
REG1BP48304 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
REG1BP48304 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
REG1BP48304 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
REG1BP48304 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
REG1BP48304 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
REG1BP48304 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
REG1BP48304 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
REG1BP48304 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
REG1BP48304 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
REG1BP48304 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
REG1BP48304 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
REG1BP48304 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
REG1BP48304 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
REG1BP48304 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
REG1BP48304 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
REG1BP48304 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
REG1BP48304 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
REG1BP48304 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
REG1BP48304 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 139.6 ms