Protein–RNA interactions for Protein: P36405

ARL3, ADP-ribosylation factor-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL3P36405 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARL3P36405 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARL3P36405 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARL3P36405 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARL3P36405 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARL3P36405 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARL3P36405 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARL3P36405 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARL3P36405 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARL3P36405 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARL3P36405 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ARL3P36405 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARL3P36405 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARL3P36405 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARL3P36405 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARL3P36405 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARL3P36405 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARL3P36405 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARL3P36405 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARL3P36405 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARL3P36405 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARL3P36405 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ARL3P36405 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARL3P36405 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ARL3P36405 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARL3P36405 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARL3P36405 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARL3P36405 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARL3P36405 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ARL3P36405 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARL3P36405 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARL3P36405 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARL3P36405 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARL3P36405 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARL3P36405 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARL3P36405 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARL3P36405 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARL3P36405 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ARL3P36405 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARL3P36405 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARL3P36405 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARL3P36405 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARL3P36405 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARL3P36405 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARL3P36405 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARL3P36405 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARL3P36405 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARL3P36405 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARL3P36405 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARL3P36405 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARL3P36405 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARL3P36405 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
ARL3P36405 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ARL3P36405 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ARL3P36405 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ARL3P36405 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ARL3P36405 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ARL3P36405 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ARL3P36405 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ARL3P36405 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ARL3P36405 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ARL3P36405 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ARL3P36405 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ARL3P36405 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ARL3P36405 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ARL3P36405 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ARL3P36405 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ARL3P36405 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ARL3P36405 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ARL3P36405 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ARL3P36405 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ARL3P36405 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ARL3P36405 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ARL3P36405 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ARL3P36405 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ARL3P36405 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ARL3P36405 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ARL3P36405 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ARL3P36405 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ARL3P36405 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ARL3P36405 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ARL3P36405 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ARL3P36405 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ARL3P36405 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ARL3P36405 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ARL3P36405 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ARL3P36405 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ARL3P36405 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ARL3P36405 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ARL3P36405 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ARL3P36405 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ARL3P36405 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ARL3P36405 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ARL3P36405 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ARL3P36405 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ARL3P36405 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ARL3P36405 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ARL3P36405 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ARL3P36405 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ARL3P36405 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.4 ms