Protein–RNA interactions for Protein: P32248

CCR7, C-C chemokine receptor type 7, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR7P32248 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
CCR7P32248 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCR7P32248 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCR7P32248 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCR7P32248 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CCR7P32248 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCR7P32248 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCR7P32248 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CCR7P32248 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCR7P32248 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCR7P32248 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCR7P32248 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCR7P32248 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCR7P32248 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCR7P32248 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCR7P32248 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCR7P32248 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCR7P32248 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCR7P32248 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCR7P32248 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCR7P32248 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCR7P32248 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CCR7P32248 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCR7P32248 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCR7P32248 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCR7P32248 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCR7P32248 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCR7P32248 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCR7P32248 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCR7P32248 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCR7P32248 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCR7P32248 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCR7P32248 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CCR7P32248 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCR7P32248 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCR7P32248 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCR7P32248 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCR7P32248 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCR7P32248 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCR7P32248 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCR7P32248 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CCR7P32248 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CCR7P32248 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCR7P32248 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCR7P32248 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCR7P32248 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCR7P32248 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CCR7P32248 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCR7P32248 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCR7P32248 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCR7P32248 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCR7P32248 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCR7P32248 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCR7P32248 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCR7P32248 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCR7P32248 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCR7P32248 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCR7P32248 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCR7P32248 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCR7P32248 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCR7P32248 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCR7P32248 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCR7P32248 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CCR7P32248 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CCR7P32248 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CCR7P32248 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCR7P32248 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCR7P32248 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCR7P32248 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCR7P32248 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCR7P32248 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCR7P32248 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCR7P32248 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCR7P32248 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCR7P32248 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCR7P32248 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCR7P32248 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCR7P32248 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCR7P32248 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCR7P32248 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCR7P32248 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCR7P32248 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCR7P32248 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCR7P32248 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CCR7P32248 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
CCR7P32248 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
CCR7P32248 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCR7P32248 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCR7P32248 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCR7P32248 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CCR7P32248 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCR7P32248 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCR7P32248 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCR7P32248 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCR7P32248 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCR7P32248 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCR7P32248 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCR7P32248 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCR7P32248 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCR7P32248 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms