Protein–RNA interactions for Protein: P22748

CA4, Carbonic anhydrase 4, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CA4P22748 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CA4P22748 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CA4P22748 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CA4P22748 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CA4P22748 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CA4P22748 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CA4P22748 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CA4P22748 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CA4P22748 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CA4P22748 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CA4P22748 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CA4P22748 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CA4P22748 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CA4P22748 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CA4P22748 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CA4P22748 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CA4P22748 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CA4P22748 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CA4P22748 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CA4P22748 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CA4P22748 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CA4P22748 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CA4P22748 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CA4P22748 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CA4P22748 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CA4P22748 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CA4P22748 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CA4P22748 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CA4P22748 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CA4P22748 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CA4P22748 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CA4P22748 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CA4P22748 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CA4P22748 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CA4P22748 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CA4P22748 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CA4P22748 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CA4P22748 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CA4P22748 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CA4P22748 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CA4P22748 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CA4P22748 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CA4P22748 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CA4P22748 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CA4P22748 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CA4P22748 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CA4P22748 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CA4P22748 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CA4P22748 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CA4P22748 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CA4P22748 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CA4P22748 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CA4P22748 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CA4P22748 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CA4P22748 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CA4P22748 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CA4P22748 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CA4P22748 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CA4P22748 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CA4P22748 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CA4P22748 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CA4P22748 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CA4P22748 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CA4P22748 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CA4P22748 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CA4P22748 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CA4P22748 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CA4P22748 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CA4P22748 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CA4P22748 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CA4P22748 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CA4P22748 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CA4P22748 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CA4P22748 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CA4P22748 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CA4P22748 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CA4P22748 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CA4P22748 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CA4P22748 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CA4P22748 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CA4P22748 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CA4P22748 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CA4P22748 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CA4P22748 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CA4P22748 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CA4P22748 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CA4P22748 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CA4P22748 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CA4P22748 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CA4P22748 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CA4P22748 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CA4P22748 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CA4P22748 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CA4P22748 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CA4P22748 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CA4P22748 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CA4P22748 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CA4P22748 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CA4P22748 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CA4P22748 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms