Protein–RNA interactions for Protein: O94966

USP19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, humanhuman

Predictions only

Length 1,318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP19O94966 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
USP19O94966 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
USP19O94966 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
USP19O94966 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
USP19O94966 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
USP19O94966 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
USP19O94966 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
USP19O94966 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
USP19O94966 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
USP19O94966 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
USP19O94966 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC29.64■■■□□ 2.34
USP19O94966 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC29.64■■■□□ 2.34
USP19O94966 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
USP19O94966 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
USP19O94966 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
USP19O94966 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
USP19O94966 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
USP19O94966 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
USP19O94966 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
USP19O94966 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
USP19O94966 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
USP19O94966 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
USP19O94966 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
USP19O94966 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
USP19O94966 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
USP19O94966 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
USP19O94966 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
USP19O94966 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
USP19O94966 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
USP19O94966 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
USP19O94966 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
USP19O94966 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
USP19O94966 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
USP19O94966 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC29.61■■■□□ 2.33
USP19O94966 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
USP19O94966 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
USP19O94966 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
USP19O94966 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
USP19O94966 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
USP19O94966 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
USP19O94966 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC29.6■■■□□ 2.33
USP19O94966 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
USP19O94966 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
USP19O94966 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC29.6■■■□□ 2.33
USP19O94966 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
USP19O94966 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
USP19O94966 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
USP19O94966 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
USP19O94966 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
USP19O94966 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
USP19O94966 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
USP19O94966 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
USP19O94966 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
USP19O94966 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
USP19O94966 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
USP19O94966 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
USP19O94966 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
USP19O94966 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
USP19O94966 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
USP19O94966 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
USP19O94966 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
USP19O94966 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
USP19O94966 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
USP19O94966 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
USP19O94966 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
USP19O94966 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
USP19O94966 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
USP19O94966 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
USP19O94966 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
USP19O94966 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
USP19O94966 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
USP19O94966 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
USP19O94966 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
USP19O94966 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
USP19O94966 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
USP19O94966 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
USP19O94966 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
USP19O94966 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
USP19O94966 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
USP19O94966 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
USP19O94966 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
USP19O94966 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
USP19O94966 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC29.57■■■□□ 2.32
USP19O94966 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
USP19O94966 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
USP19O94966 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
USP19O94966 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
USP19O94966 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
USP19O94966 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
USP19O94966 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
USP19O94966 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
USP19O94966 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
USP19O94966 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
USP19O94966 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
USP19O94966 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
USP19O94966 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
USP19O94966 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
USP19O94966 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
USP19O94966 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
USP19O94966 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms