Protein–RNA interactions for Protein: O15394

NCAM2, Neural cell adhesion molecule 2, humanhuman

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAM2O15394 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NCAM2O15394 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NCAM2O15394 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NCAM2O15394 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NCAM2O15394 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NCAM2O15394 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NCAM2O15394 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NCAM2O15394 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NCAM2O15394 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
NCAM2O15394 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NCAM2O15394 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NCAM2O15394 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NCAM2O15394 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NCAM2O15394 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NCAM2O15394 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NCAM2O15394 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NCAM2O15394 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NCAM2O15394 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NCAM2O15394 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NCAM2O15394 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NCAM2O15394 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NCAM2O15394 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NCAM2O15394 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NCAM2O15394 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NCAM2O15394 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NCAM2O15394 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NCAM2O15394 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NCAM2O15394 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
NCAM2O15394 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NCAM2O15394 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NCAM2O15394 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NCAM2O15394 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NCAM2O15394 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NCAM2O15394 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NCAM2O15394 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NCAM2O15394 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NCAM2O15394 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NCAM2O15394 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NCAM2O15394 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NCAM2O15394 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NCAM2O15394 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NCAM2O15394 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NCAM2O15394 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NCAM2O15394 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NCAM2O15394 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NCAM2O15394 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NCAM2O15394 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NCAM2O15394 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NCAM2O15394 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
NCAM2O15394 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
NCAM2O15394 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
NCAM2O15394 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NCAM2O15394 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NCAM2O15394 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NCAM2O15394 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NCAM2O15394 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NCAM2O15394 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NCAM2O15394 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NCAM2O15394 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NCAM2O15394 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NCAM2O15394 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NCAM2O15394 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NCAM2O15394 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NCAM2O15394 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
NCAM2O15394 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NCAM2O15394 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NCAM2O15394 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NCAM2O15394 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
NCAM2O15394 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NCAM2O15394 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NCAM2O15394 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NCAM2O15394 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NCAM2O15394 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NCAM2O15394 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NCAM2O15394 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NCAM2O15394 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NCAM2O15394 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NCAM2O15394 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NCAM2O15394 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NCAM2O15394 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NCAM2O15394 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NCAM2O15394 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NCAM2O15394 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NCAM2O15394 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NCAM2O15394 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
NCAM2O15394 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NCAM2O15394 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NCAM2O15394 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NCAM2O15394 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NCAM2O15394 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NCAM2O15394 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NCAM2O15394 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NCAM2O15394 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NCAM2O15394 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NCAM2O15394 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NCAM2O15394 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NCAM2O15394 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
NCAM2O15394 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NCAM2O15394 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NCAM2O15394 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms