Protein–RNA interactions for Protein: O00515

LAD1, Ladinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAD1O00515 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LAD1O00515 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LAD1O00515 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LAD1O00515 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LAD1O00515 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LAD1O00515 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LAD1O00515 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LAD1O00515 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LAD1O00515 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LAD1O00515 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LAD1O00515 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LAD1O00515 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LAD1O00515 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LAD1O00515 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LAD1O00515 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LAD1O00515 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LAD1O00515 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LAD1O00515 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LAD1O00515 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LAD1O00515 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LAD1O00515 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LAD1O00515 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LAD1O00515 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LAD1O00515 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
LAD1O00515 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LAD1O00515 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LAD1O00515 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LAD1O00515 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LAD1O00515 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LAD1O00515 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LAD1O00515 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LAD1O00515 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LAD1O00515 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LAD1O00515 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LAD1O00515 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LAD1O00515 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LAD1O00515 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LAD1O00515 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LAD1O00515 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LAD1O00515 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LAD1O00515 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LAD1O00515 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
LAD1O00515 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
LAD1O00515 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
LAD1O00515 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
LAD1O00515 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LAD1O00515 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LAD1O00515 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LAD1O00515 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LAD1O00515 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LAD1O00515 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LAD1O00515 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LAD1O00515 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LAD1O00515 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LAD1O00515 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LAD1O00515 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LAD1O00515 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LAD1O00515 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LAD1O00515 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LAD1O00515 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LAD1O00515 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LAD1O00515 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
LAD1O00515 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LAD1O00515 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
LAD1O00515 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
LAD1O00515 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LAD1O00515 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LAD1O00515 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LAD1O00515 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LAD1O00515 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LAD1O00515 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LAD1O00515 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LAD1O00515 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LAD1O00515 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LAD1O00515 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LAD1O00515 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LAD1O00515 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LAD1O00515 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
LAD1O00515 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LAD1O00515 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LAD1O00515 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LAD1O00515 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
LAD1O00515 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LAD1O00515 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LAD1O00515 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LAD1O00515 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LAD1O00515 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LAD1O00515 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LAD1O00515 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LAD1O00515 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LAD1O00515 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LAD1O00515 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
LAD1O00515 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LAD1O00515 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LAD1O00515 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LAD1O00515 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
LAD1O00515 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LAD1O00515 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
LAD1O00515 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LAD1O00515 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms