Protein–RNA interactions for Protein: O00273

DFFA, DNA fragmentation factor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DFFAO00273 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DFFAO00273 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DFFAO00273 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DFFAO00273 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DFFAO00273 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DFFAO00273 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DFFAO00273 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DFFAO00273 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DFFAO00273 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DFFAO00273 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DFFAO00273 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DFFAO00273 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DFFAO00273 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DFFAO00273 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
DFFAO00273 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DFFAO00273 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DFFAO00273 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DFFAO00273 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DFFAO00273 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DFFAO00273 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
DFFAO00273 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
DFFAO00273 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DFFAO00273 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DFFAO00273 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DFFAO00273 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DFFAO00273 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DFFAO00273 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DFFAO00273 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
DFFAO00273 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
DFFAO00273 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DFFAO00273 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DFFAO00273 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DFFAO00273 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DFFAO00273 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DFFAO00273 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DFFAO00273 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DFFAO00273 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DFFAO00273 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DFFAO00273 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DFFAO00273 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DFFAO00273 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DFFAO00273 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DFFAO00273 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DFFAO00273 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DFFAO00273 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
DFFAO00273 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
DFFAO00273 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DFFAO00273 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
DFFAO00273 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
DFFAO00273 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DFFAO00273 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
DFFAO00273 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DFFAO00273 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
DFFAO00273 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
DFFAO00273 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
DFFAO00273 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DFFAO00273 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DFFAO00273 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DFFAO00273 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DFFAO00273 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DFFAO00273 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DFFAO00273 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DFFAO00273 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DFFAO00273 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DFFAO00273 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DFFAO00273 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
DFFAO00273 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DFFAO00273 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DFFAO00273 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DFFAO00273 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DFFAO00273 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DFFAO00273 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DFFAO00273 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DFFAO00273 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DFFAO00273 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DFFAO00273 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DFFAO00273 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DFFAO00273 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DFFAO00273 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DFFAO00273 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
DFFAO00273 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DFFAO00273 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DFFAO00273 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DFFAO00273 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DFFAO00273 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DFFAO00273 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
DFFAO00273 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DFFAO00273 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DFFAO00273 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
DFFAO00273 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DFFAO00273 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DFFAO00273 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DFFAO00273 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DFFAO00273 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DFFAO00273 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
DFFAO00273 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DFFAO00273 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DFFAO00273 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DFFAO00273 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DFFAO00273 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.1 ms