Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI6

SLF1, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,058 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLF1Q9BQI6 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLF1Q9BQI6 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLF1Q9BQI6 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLF1Q9BQI6 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLF1Q9BQI6 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLF1Q9BQI6 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLF1Q9BQI6 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLF1Q9BQI6 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
SLF1Q9BQI6 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLF1Q9BQI6 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLF1Q9BQI6 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLF1Q9BQI6 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLF1Q9BQI6 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLF1Q9BQI6 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLF1Q9BQI6 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLF1Q9BQI6 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SLF1Q9BQI6 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLF1Q9BQI6 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLF1Q9BQI6 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SLF1Q9BQI6 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLF1Q9BQI6 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLF1Q9BQI6 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLF1Q9BQI6 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLF1Q9BQI6 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLF1Q9BQI6 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLF1Q9BQI6 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLF1Q9BQI6 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLF1Q9BQI6 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLF1Q9BQI6 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLF1Q9BQI6 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLF1Q9BQI6 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLF1Q9BQI6 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLF1Q9BQI6 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
SLF1Q9BQI6 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
SLF1Q9BQI6 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLF1Q9BQI6 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLF1Q9BQI6 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLF1Q9BQI6 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLF1Q9BQI6 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLF1Q9BQI6 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLF1Q9BQI6 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLF1Q9BQI6 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLF1Q9BQI6 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLF1Q9BQI6 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLF1Q9BQI6 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLF1Q9BQI6 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLF1Q9BQI6 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
SLF1Q9BQI6 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLF1Q9BQI6 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLF1Q9BQI6 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLF1Q9BQI6 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLF1Q9BQI6 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLF1Q9BQI6 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLF1Q9BQI6 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLF1Q9BQI6 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLF1Q9BQI6 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLF1Q9BQI6 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SLF1Q9BQI6 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SLF1Q9BQI6 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SLF1Q9BQI6 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SLF1Q9BQI6 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SLF1Q9BQI6 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLF1Q9BQI6 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLF1Q9BQI6 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLF1Q9BQI6 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLF1Q9BQI6 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLF1Q9BQI6 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLF1Q9BQI6 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLF1Q9BQI6 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLF1Q9BQI6 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLF1Q9BQI6 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLF1Q9BQI6 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLF1Q9BQI6 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLF1Q9BQI6 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLF1Q9BQI6 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLF1Q9BQI6 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
SLF1Q9BQI6 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLF1Q9BQI6 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
SLF1Q9BQI6 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLF1Q9BQI6 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLF1Q9BQI6 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLF1Q9BQI6 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLF1Q9BQI6 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLF1Q9BQI6 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLF1Q9BQI6 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
SLF1Q9BQI6 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLF1Q9BQI6 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLF1Q9BQI6 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLF1Q9BQI6 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLF1Q9BQI6 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLF1Q9BQI6 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLF1Q9BQI6 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
SLF1Q9BQI6 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLF1Q9BQI6 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLF1Q9BQI6 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLF1Q9BQI6 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLF1Q9BQI6 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
SLF1Q9BQI6 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLF1Q9BQI6 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLF1Q9BQI6 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms