Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT4

SAMD8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD8Q96LT4 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SAMD8Q96LT4 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SAMD8Q96LT4 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SAMD8Q96LT4 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SAMD8Q96LT4 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SAMD8Q96LT4 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SAMD8Q96LT4 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SAMD8Q96LT4 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SAMD8Q96LT4 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SAMD8Q96LT4 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SAMD8Q96LT4 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SAMD8Q96LT4 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SAMD8Q96LT4 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SAMD8Q96LT4 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SAMD8Q96LT4 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SAMD8Q96LT4 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SAMD8Q96LT4 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SAMD8Q96LT4 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SAMD8Q96LT4 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
SAMD8Q96LT4 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SAMD8Q96LT4 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SAMD8Q96LT4 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SAMD8Q96LT4 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SAMD8Q96LT4 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SAMD8Q96LT4 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
SAMD8Q96LT4 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
SAMD8Q96LT4 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
SAMD8Q96LT4 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SAMD8Q96LT4 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SAMD8Q96LT4 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SAMD8Q96LT4 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SAMD8Q96LT4 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SAMD8Q96LT4 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SAMD8Q96LT4 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SAMD8Q96LT4 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SAMD8Q96LT4 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SAMD8Q96LT4 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SAMD8Q96LT4 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SAMD8Q96LT4 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SAMD8Q96LT4 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SAMD8Q96LT4 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SAMD8Q96LT4 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
SAMD8Q96LT4 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SAMD8Q96LT4 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SAMD8Q96LT4 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SAMD8Q96LT4 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
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SAMD8Q96LT4 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SAMD8Q96LT4 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
SAMD8Q96LT4 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SAMD8Q96LT4 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SAMD8Q96LT4 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SAMD8Q96LT4 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SAMD8Q96LT4 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
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SAMD8Q96LT4 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SAMD8Q96LT4 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SAMD8Q96LT4 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SAMD8Q96LT4 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SAMD8Q96LT4 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SAMD8Q96LT4 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SAMD8Q96LT4 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
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SAMD8Q96LT4 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SAMD8Q96LT4 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SAMD8Q96LT4 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SAMD8Q96LT4 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SAMD8Q96LT4 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SAMD8Q96LT4 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SAMD8Q96LT4 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SAMD8Q96LT4 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SAMD8Q96LT4 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SAMD8Q96LT4 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SAMD8Q96LT4 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SAMD8Q96LT4 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SAMD8Q96LT4 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SAMD8Q96LT4 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SAMD8Q96LT4 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SAMD8Q96LT4 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SAMD8Q96LT4 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SAMD8Q96LT4 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SAMD8Q96LT4 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SAMD8Q96LT4 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SAMD8Q96LT4 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SAMD8Q96LT4 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SAMD8Q96LT4 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SAMD8Q96LT4 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
SAMD8Q96LT4 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
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