Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYA6

CKAP2L, Cytoskeleton-associated protein 2-like, humanhuman

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP2LQ8IYA6 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CKAP2LQ8IYA6 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CKAP2LQ8IYA6 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CKAP2LQ8IYA6 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CKAP2LQ8IYA6 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CKAP2LQ8IYA6 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CKAP2LQ8IYA6 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CKAP2LQ8IYA6 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CKAP2LQ8IYA6 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CKAP2LQ8IYA6 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CKAP2LQ8IYA6 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CKAP2LQ8IYA6 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CKAP2LQ8IYA6 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CKAP2LQ8IYA6 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CKAP2LQ8IYA6 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CKAP2LQ8IYA6 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CKAP2LQ8IYA6 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CKAP2LQ8IYA6 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CKAP2LQ8IYA6 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CKAP2LQ8IYA6 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CKAP2LQ8IYA6 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CKAP2LQ8IYA6 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CKAP2LQ8IYA6 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CKAP2LQ8IYA6 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CKAP2LQ8IYA6 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CKAP2LQ8IYA6 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CKAP2LQ8IYA6 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CKAP2LQ8IYA6 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CKAP2LQ8IYA6 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CKAP2LQ8IYA6 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CKAP2LQ8IYA6 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CKAP2LQ8IYA6 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CKAP2LQ8IYA6 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CKAP2LQ8IYA6 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CKAP2LQ8IYA6 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CKAP2LQ8IYA6 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CKAP2LQ8IYA6 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CKAP2LQ8IYA6 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CKAP2LQ8IYA6 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CKAP2LQ8IYA6 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CKAP2LQ8IYA6 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CKAP2LQ8IYA6 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CKAP2LQ8IYA6 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CKAP2LQ8IYA6 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CKAP2LQ8IYA6 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CKAP2LQ8IYA6 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CKAP2LQ8IYA6 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CKAP2LQ8IYA6 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CKAP2LQ8IYA6 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CKAP2LQ8IYA6 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CKAP2LQ8IYA6 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
CKAP2LQ8IYA6 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CKAP2LQ8IYA6 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CKAP2LQ8IYA6 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CKAP2LQ8IYA6 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CKAP2LQ8IYA6 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CKAP2LQ8IYA6 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CKAP2LQ8IYA6 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CKAP2LQ8IYA6 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CKAP2LQ8IYA6 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CKAP2LQ8IYA6 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CKAP2LQ8IYA6 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CKAP2LQ8IYA6 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CKAP2LQ8IYA6 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CKAP2LQ8IYA6 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CKAP2LQ8IYA6 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CKAP2LQ8IYA6 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CKAP2LQ8IYA6 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CKAP2LQ8IYA6 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CKAP2LQ8IYA6 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CKAP2LQ8IYA6 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CKAP2LQ8IYA6 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CKAP2LQ8IYA6 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CKAP2LQ8IYA6 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CKAP2LQ8IYA6 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CKAP2LQ8IYA6 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CKAP2LQ8IYA6 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CKAP2LQ8IYA6 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CKAP2LQ8IYA6 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CKAP2LQ8IYA6 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CKAP2LQ8IYA6 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CKAP2LQ8IYA6 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CKAP2LQ8IYA6 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CKAP2LQ8IYA6 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CKAP2LQ8IYA6 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CKAP2LQ8IYA6 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CKAP2LQ8IYA6 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CKAP2LQ8IYA6 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CKAP2LQ8IYA6 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CKAP2LQ8IYA6 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CKAP2LQ8IYA6 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CKAP2LQ8IYA6 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CKAP2LQ8IYA6 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CKAP2LQ8IYA6 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CKAP2LQ8IYA6 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CKAP2LQ8IYA6 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CKAP2LQ8IYA6 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CKAP2LQ8IYA6 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CKAP2LQ8IYA6 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CKAP2LQ8IYA6 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms