Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRD0

WASHC2D, WASH complex subunit 2D, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WASHC2DQ5SRD0 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
WASHC2DQ5SRD0 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
WASHC2DQ5SRD0 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
WASHC2DQ5SRD0 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
WASHC2DQ5SRD0 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
WASHC2DQ5SRD0 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
WASHC2DQ5SRD0 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
WASHC2DQ5SRD0 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
WASHC2DQ5SRD0 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
WASHC2DQ5SRD0 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
WASHC2DQ5SRD0 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
WASHC2DQ5SRD0 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
WASHC2DQ5SRD0 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
WASHC2DQ5SRD0 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
WASHC2DQ5SRD0 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
WASHC2DQ5SRD0 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
WASHC2DQ5SRD0 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
WASHC2DQ5SRD0 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
WASHC2DQ5SRD0 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
WASHC2DQ5SRD0 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
WASHC2DQ5SRD0 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
WASHC2DQ5SRD0 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
WASHC2DQ5SRD0 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
WASHC2DQ5SRD0 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
WASHC2DQ5SRD0 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
WASHC2DQ5SRD0 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
WASHC2DQ5SRD0 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
WASHC2DQ5SRD0 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
WASHC2DQ5SRD0 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
WASHC2DQ5SRD0 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
WASHC2DQ5SRD0 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
WASHC2DQ5SRD0 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
WASHC2DQ5SRD0 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
WASHC2DQ5SRD0 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
WASHC2DQ5SRD0 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
WASHC2DQ5SRD0 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
WASHC2DQ5SRD0 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
WASHC2DQ5SRD0 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
WASHC2DQ5SRD0 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
WASHC2DQ5SRD0 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
WASHC2DQ5SRD0 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
WASHC2DQ5SRD0 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
WASHC2DQ5SRD0 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
WASHC2DQ5SRD0 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
WASHC2DQ5SRD0 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
WASHC2DQ5SRD0 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
WASHC2DQ5SRD0 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
WASHC2DQ5SRD0 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
WASHC2DQ5SRD0 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
WASHC2DQ5SRD0 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
WASHC2DQ5SRD0 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
WASHC2DQ5SRD0 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
WASHC2DQ5SRD0 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
WASHC2DQ5SRD0 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
WASHC2DQ5SRD0 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
WASHC2DQ5SRD0 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
WASHC2DQ5SRD0 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
WASHC2DQ5SRD0 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
WASHC2DQ5SRD0 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
WASHC2DQ5SRD0 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
WASHC2DQ5SRD0 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
WASHC2DQ5SRD0 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
WASHC2DQ5SRD0 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
WASHC2DQ5SRD0 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
WASHC2DQ5SRD0 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
WASHC2DQ5SRD0 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
WASHC2DQ5SRD0 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
WASHC2DQ5SRD0 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
WASHC2DQ5SRD0 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
WASHC2DQ5SRD0 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
WASHC2DQ5SRD0 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
WASHC2DQ5SRD0 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
WASHC2DQ5SRD0 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
WASHC2DQ5SRD0 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
WASHC2DQ5SRD0 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
WASHC2DQ5SRD0 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
WASHC2DQ5SRD0 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
WASHC2DQ5SRD0 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
WASHC2DQ5SRD0 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
WASHC2DQ5SRD0 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
WASHC2DQ5SRD0 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
WASHC2DQ5SRD0 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
WASHC2DQ5SRD0 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
WASHC2DQ5SRD0 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
WASHC2DQ5SRD0 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
WASHC2DQ5SRD0 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
WASHC2DQ5SRD0 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
WASHC2DQ5SRD0 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
WASHC2DQ5SRD0 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
WASHC2DQ5SRD0 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
WASHC2DQ5SRD0 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
WASHC2DQ5SRD0 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
WASHC2DQ5SRD0 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
WASHC2DQ5SRD0 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
WASHC2DQ5SRD0 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
WASHC2DQ5SRD0 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
WASHC2DQ5SRD0 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
WASHC2DQ5SRD0 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
WASHC2DQ5SRD0 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
WASHC2DQ5SRD0 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.7 ms