Protein–RNA interactions for Protein: Q16572

SLC18A3, Vesicular acetylcholine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A3Q16572 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC18A3Q16572 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC18A3Q16572 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC18A3Q16572 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC18A3Q16572 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC18A3Q16572 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC18A3Q16572 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC18A3Q16572 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC18A3Q16572 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC18A3Q16572 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC18A3Q16572 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC18A3Q16572 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC18A3Q16572 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC18A3Q16572 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC18A3Q16572 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC18A3Q16572 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC18A3Q16572 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC18A3Q16572 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC18A3Q16572 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC18A3Q16572 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC18A3Q16572 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC18A3Q16572 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC18A3Q16572 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC18A3Q16572 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC18A3Q16572 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC18A3Q16572 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC18A3Q16572 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC18A3Q16572 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC18A3Q16572 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC18A3Q16572 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC18A3Q16572 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC18A3Q16572 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC18A3Q16572 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC18A3Q16572 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC18A3Q16572 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC18A3Q16572 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC18A3Q16572 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC18A3Q16572 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC18A3Q16572 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC18A3Q16572 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC18A3Q16572 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC18A3Q16572 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC18A3Q16572 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC18A3Q16572 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC18A3Q16572 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC18A3Q16572 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC18A3Q16572 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC18A3Q16572 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC18A3Q16572 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC18A3Q16572 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC18A3Q16572 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
SLC18A3Q16572 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC18A3Q16572 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC18A3Q16572 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC18A3Q16572 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC18A3Q16572 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC18A3Q16572 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC18A3Q16572 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC18A3Q16572 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC18A3Q16572 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC18A3Q16572 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC18A3Q16572 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC18A3Q16572 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC18A3Q16572 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC18A3Q16572 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC18A3Q16572 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC18A3Q16572 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC18A3Q16572 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC18A3Q16572 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC18A3Q16572 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC18A3Q16572 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC18A3Q16572 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC18A3Q16572 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC18A3Q16572 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC18A3Q16572 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC18A3Q16572 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC18A3Q16572 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC18A3Q16572 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC18A3Q16572 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC18A3Q16572 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC18A3Q16572 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC18A3Q16572 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC18A3Q16572 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC18A3Q16572 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC18A3Q16572 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC18A3Q16572 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC18A3Q16572 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC18A3Q16572 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC18A3Q16572 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC18A3Q16572 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC18A3Q16572 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC18A3Q16572 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC18A3Q16572 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC18A3Q16572 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC18A3Q16572 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC18A3Q16572 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC18A3Q16572 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC18A3Q16572 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC18A3Q16572 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC18A3Q16572 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms