Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NEDD8Q15843 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NEDD8Q15843 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NEDD8Q15843 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
NEDD8Q15843 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NEDD8Q15843 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NEDD8Q15843 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NEDD8Q15843 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NEDD8Q15843 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NEDD8Q15843 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NEDD8Q15843 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NEDD8Q15843 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NEDD8Q15843 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NEDD8Q15843 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NEDD8Q15843 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NEDD8Q15843 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NEDD8Q15843 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NEDD8Q15843 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NEDD8Q15843 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NEDD8Q15843 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NEDD8Q15843 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NEDD8Q15843 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NEDD8Q15843 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NEDD8Q15843 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NEDD8Q15843 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
NEDD8Q15843 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NEDD8Q15843 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NEDD8Q15843 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NEDD8Q15843 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NEDD8Q15843 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NEDD8Q15843 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NEDD8Q15843 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NEDD8Q15843 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NEDD8Q15843 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NEDD8Q15843 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NEDD8Q15843 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NEDD8Q15843 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NEDD8Q15843 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
NEDD8Q15843 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
NEDD8Q15843 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
NEDD8Q15843 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
NEDD8Q15843 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NEDD8Q15843 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NEDD8Q15843 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NEDD8Q15843 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NEDD8Q15843 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NEDD8Q15843 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NEDD8Q15843 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NEDD8Q15843 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NEDD8Q15843 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NEDD8Q15843 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NEDD8Q15843 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NEDD8Q15843 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NEDD8Q15843 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
NEDD8Q15843 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NEDD8Q15843 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NEDD8Q15843 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NEDD8Q15843 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NEDD8Q15843 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NEDD8Q15843 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NEDD8Q15843 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NEDD8Q15843 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NEDD8Q15843 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NEDD8Q15843 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NEDD8Q15843 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NEDD8Q15843 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NEDD8Q15843 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
NEDD8Q15843 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NEDD8Q15843 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NEDD8Q15843 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
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NEDD8Q15843 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NEDD8Q15843 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NEDD8Q15843 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NEDD8Q15843 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NEDD8Q15843 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NEDD8Q15843 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NEDD8Q15843 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NEDD8Q15843 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NEDD8Q15843 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NEDD8Q15843 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NEDD8Q15843 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
NEDD8Q15843 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NEDD8Q15843 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NEDD8Q15843 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NEDD8Q15843 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NEDD8Q15843 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NEDD8Q15843 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NEDD8Q15843 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NEDD8Q15843 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NEDD8Q15843 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NEDD8Q15843 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NEDD8Q15843 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NEDD8Q15843 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NEDD8Q15843 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
NEDD8Q15843 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NEDD8Q15843 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NEDD8Q15843 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NEDD8Q15843 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NEDD8Q15843 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
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