Protein–RNA interactions for Protein: Q12965

MYO1E, Unconventional myosin-Ie, humanhuman

Predictions only

Length 1,108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYO1EQ12965 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MYO1EQ12965 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MYO1EQ12965 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MYO1EQ12965 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MYO1EQ12965 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MYO1EQ12965 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MYO1EQ12965 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MYO1EQ12965 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MYO1EQ12965 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MYO1EQ12965 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MYO1EQ12965 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MYO1EQ12965 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MYO1EQ12965 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
MYO1EQ12965 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MYO1EQ12965 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MYO1EQ12965 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MYO1EQ12965 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MYO1EQ12965 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MYO1EQ12965 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MYO1EQ12965 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MYO1EQ12965 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MYO1EQ12965 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MYO1EQ12965 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MYO1EQ12965 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MYO1EQ12965 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MYO1EQ12965 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MYO1EQ12965 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MYO1EQ12965 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MYO1EQ12965 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MYO1EQ12965 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MYO1EQ12965 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
MYO1EQ12965 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MYO1EQ12965 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MYO1EQ12965 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MYO1EQ12965 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MYO1EQ12965 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MYO1EQ12965 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MYO1EQ12965 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MYO1EQ12965 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MYO1EQ12965 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MYO1EQ12965 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MYO1EQ12965 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MYO1EQ12965 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
MYO1EQ12965 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MYO1EQ12965 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MYO1EQ12965 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MYO1EQ12965 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MYO1EQ12965 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
MYO1EQ12965 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MYO1EQ12965 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MYO1EQ12965 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MYO1EQ12965 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MYO1EQ12965 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MYO1EQ12965 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MYO1EQ12965 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MYO1EQ12965 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MYO1EQ12965 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MYO1EQ12965 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
MYO1EQ12965 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MYO1EQ12965 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MYO1EQ12965 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MYO1EQ12965 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MYO1EQ12965 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MYO1EQ12965 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MYO1EQ12965 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MYO1EQ12965 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MYO1EQ12965 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MYO1EQ12965 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MYO1EQ12965 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MYO1EQ12965 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MYO1EQ12965 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MYO1EQ12965 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MYO1EQ12965 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MYO1EQ12965 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MYO1EQ12965 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MYO1EQ12965 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MYO1EQ12965 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MYO1EQ12965 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MYO1EQ12965 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MYO1EQ12965 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MYO1EQ12965 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MYO1EQ12965 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MYO1EQ12965 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MYO1EQ12965 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MYO1EQ12965 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MYO1EQ12965 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MYO1EQ12965 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MYO1EQ12965 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MYO1EQ12965 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MYO1EQ12965 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MYO1EQ12965 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MYO1EQ12965 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MYO1EQ12965 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MYO1EQ12965 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MYO1EQ12965 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MYO1EQ12965 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MYO1EQ12965 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MYO1EQ12965 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MYO1EQ12965 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MYO1EQ12965 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms