Protein–RNA interactions for Protein: P61221

ABCE1, ATP-binding cassette sub-family E member 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCE1P61221 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ABCE1P61221 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ABCE1P61221 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ABCE1P61221 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ABCE1P61221 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ABCE1P61221 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ABCE1P61221 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ABCE1P61221 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ABCE1P61221 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ABCE1P61221 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ABCE1P61221 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ABCE1P61221 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ABCE1P61221 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ABCE1P61221 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ABCE1P61221 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ABCE1P61221 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ABCE1P61221 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ABCE1P61221 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ABCE1P61221 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ABCE1P61221 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ABCE1P61221 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ABCE1P61221 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ABCE1P61221 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ABCE1P61221 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ABCE1P61221 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ABCE1P61221 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ABCE1P61221 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ABCE1P61221 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ABCE1P61221 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ABCE1P61221 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ABCE1P61221 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ABCE1P61221 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ABCE1P61221 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ABCE1P61221 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ABCE1P61221 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ABCE1P61221 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ABCE1P61221 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ABCE1P61221 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ABCE1P61221 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ABCE1P61221 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ABCE1P61221 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ABCE1P61221 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ABCE1P61221 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ABCE1P61221 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ABCE1P61221 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ABCE1P61221 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ABCE1P61221 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ABCE1P61221 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ABCE1P61221 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ABCE1P61221 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ABCE1P61221 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ABCE1P61221 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ABCE1P61221 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ABCE1P61221 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ABCE1P61221 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ABCE1P61221 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ABCE1P61221 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ABCE1P61221 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ABCE1P61221 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ABCE1P61221 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ABCE1P61221 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ABCE1P61221 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ABCE1P61221 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ABCE1P61221 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ABCE1P61221 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ABCE1P61221 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ABCE1P61221 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ABCE1P61221 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ABCE1P61221 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ABCE1P61221 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ABCE1P61221 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ABCE1P61221 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ABCE1P61221 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ABCE1P61221 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ABCE1P61221 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ABCE1P61221 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ABCE1P61221 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ABCE1P61221 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ABCE1P61221 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ABCE1P61221 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ABCE1P61221 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ABCE1P61221 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ABCE1P61221 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ABCE1P61221 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ABCE1P61221 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ABCE1P61221 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ABCE1P61221 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ABCE1P61221 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ABCE1P61221 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ABCE1P61221 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ABCE1P61221 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ABCE1P61221 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ABCE1P61221 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ABCE1P61221 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ABCE1P61221 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ABCE1P61221 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ABCE1P61221 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ABCE1P61221 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ABCE1P61221 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ABCE1P61221 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms