Protein–RNA interactions for Protein: P59089

LINC00205, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00205, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00205P59089 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LINC00205P59089 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LINC00205P59089 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LINC00205P59089 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LINC00205P59089 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LINC00205P59089 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LINC00205P59089 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LINC00205P59089 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LINC00205P59089 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LINC00205P59089 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LINC00205P59089 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LINC00205P59089 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LINC00205P59089 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LINC00205P59089 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LINC00205P59089 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LINC00205P59089 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LINC00205P59089 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LINC00205P59089 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LINC00205P59089 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LINC00205P59089 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LINC00205P59089 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LINC00205P59089 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LINC00205P59089 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LINC00205P59089 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LINC00205P59089 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LINC00205P59089 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
LINC00205P59089 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
LINC00205P59089 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LINC00205P59089 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LINC00205P59089 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LINC00205P59089 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LINC00205P59089 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LINC00205P59089 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LINC00205P59089 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LINC00205P59089 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LINC00205P59089 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LINC00205P59089 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LINC00205P59089 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LINC00205P59089 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LINC00205P59089 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LINC00205P59089 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LINC00205P59089 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LINC00205P59089 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LINC00205P59089 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LINC00205P59089 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LINC00205P59089 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LINC00205P59089 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LINC00205P59089 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LINC00205P59089 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LINC00205P59089 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LINC00205P59089 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LINC00205P59089 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LINC00205P59089 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LINC00205P59089 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LINC00205P59089 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LINC00205P59089 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LINC00205P59089 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LINC00205P59089 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LINC00205P59089 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LINC00205P59089 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LINC00205P59089 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LINC00205P59089 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
LINC00205P59089 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LINC00205P59089 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LINC00205P59089 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LINC00205P59089 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LINC00205P59089 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LINC00205P59089 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LINC00205P59089 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LINC00205P59089 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LINC00205P59089 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LINC00205P59089 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LINC00205P59089 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LINC00205P59089 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LINC00205P59089 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LINC00205P59089 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LINC00205P59089 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
LINC00205P59089 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
LINC00205P59089 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
LINC00205P59089 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
LINC00205P59089 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
LINC00205P59089 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LINC00205P59089 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LINC00205P59089 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
LINC00205P59089 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
LINC00205P59089 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
LINC00205P59089 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
LINC00205P59089 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
LINC00205P59089 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LINC00205P59089 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LINC00205P59089 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LINC00205P59089 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LINC00205P59089 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LINC00205P59089 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LINC00205P59089 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LINC00205P59089 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LINC00205P59089 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LINC00205P59089 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LINC00205P59089 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LINC00205P59089 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 134.9 ms