Protein–RNA interactions for Protein: P0DMW5

SMIM10L2B, Small integral membrane protein 10-like protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM10L2BP0DMW5 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMIM10L2BP0DMW5 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMIM10L2BP0DMW5 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMIM10L2BP0DMW5 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMIM10L2BP0DMW5 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMIM10L2BP0DMW5 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SMIM10L2BP0DMW5 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMIM10L2BP0DMW5 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMIM10L2BP0DMW5 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMIM10L2BP0DMW5 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMIM10L2BP0DMW5 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMIM10L2BP0DMW5 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMIM10L2BP0DMW5 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMIM10L2BP0DMW5 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMIM10L2BP0DMW5 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMIM10L2BP0DMW5 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMIM10L2BP0DMW5 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMIM10L2BP0DMW5 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMIM10L2BP0DMW5 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMIM10L2BP0DMW5 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMIM10L2BP0DMW5 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMIM10L2BP0DMW5 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMIM10L2BP0DMW5 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SMIM10L2BP0DMW5 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SMIM10L2BP0DMW5 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SMIM10L2BP0DMW5 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SMIM10L2BP0DMW5 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SMIM10L2BP0DMW5 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SMIM10L2BP0DMW5 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SMIM10L2BP0DMW5 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SMIM10L2BP0DMW5 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMIM10L2BP0DMW5 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMIM10L2BP0DMW5 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMIM10L2BP0DMW5 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMIM10L2BP0DMW5 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMIM10L2BP0DMW5 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMIM10L2BP0DMW5 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMIM10L2BP0DMW5 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMIM10L2BP0DMW5 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMIM10L2BP0DMW5 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMIM10L2BP0DMW5 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMIM10L2BP0DMW5 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMIM10L2BP0DMW5 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMIM10L2BP0DMW5 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMIM10L2BP0DMW5 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMIM10L2BP0DMW5 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMIM10L2BP0DMW5 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMIM10L2BP0DMW5 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMIM10L2BP0DMW5 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SMIM10L2BP0DMW5 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMIM10L2BP0DMW5 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMIM10L2BP0DMW5 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMIM10L2BP0DMW5 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMIM10L2BP0DMW5 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMIM10L2BP0DMW5 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SMIM10L2BP0DMW5 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMIM10L2BP0DMW5 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SMIM10L2BP0DMW5 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMIM10L2BP0DMW5 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMIM10L2BP0DMW5 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMIM10L2BP0DMW5 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMIM10L2BP0DMW5 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMIM10L2BP0DMW5 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMIM10L2BP0DMW5 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMIM10L2BP0DMW5 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMIM10L2BP0DMW5 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMIM10L2BP0DMW5 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMIM10L2BP0DMW5 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMIM10L2BP0DMW5 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMIM10L2BP0DMW5 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMIM10L2BP0DMW5 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMIM10L2BP0DMW5 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMIM10L2BP0DMW5 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SMIM10L2BP0DMW5 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMIM10L2BP0DMW5 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SMIM10L2BP0DMW5 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMIM10L2BP0DMW5 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMIM10L2BP0DMW5 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMIM10L2BP0DMW5 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMIM10L2BP0DMW5 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMIM10L2BP0DMW5 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SMIM10L2BP0DMW5 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMIM10L2BP0DMW5 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMIM10L2BP0DMW5 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMIM10L2BP0DMW5 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMIM10L2BP0DMW5 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMIM10L2BP0DMW5 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SMIM10L2BP0DMW5 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMIM10L2BP0DMW5 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SMIM10L2BP0DMW5 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SMIM10L2BP0DMW5 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SMIM10L2BP0DMW5 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SMIM10L2BP0DMW5 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SMIM10L2BP0DMW5 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SMIM10L2BP0DMW5 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SMIM10L2BP0DMW5 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SMIM10L2BP0DMW5 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMIM10L2BP0DMW5 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMIM10L2BP0DMW5 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMIM10L2BP0DMW5 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms