Protein–RNA interactions for Protein: O60931

CTNS, Cystinosin, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNSO60931 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTNSO60931 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTNSO60931 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTNSO60931 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTNSO60931 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTNSO60931 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTNSO60931 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTNSO60931 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTNSO60931 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTNSO60931 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTNSO60931 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTNSO60931 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTNSO60931 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CTNSO60931 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTNSO60931 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTNSO60931 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTNSO60931 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTNSO60931 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTNSO60931 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTNSO60931 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTNSO60931 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTNSO60931 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTNSO60931 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTNSO60931 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTNSO60931 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTNSO60931 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTNSO60931 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTNSO60931 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTNSO60931 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTNSO60931 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTNSO60931 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTNSO60931 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTNSO60931 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTNSO60931 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTNSO60931 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTNSO60931 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTNSO60931 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTNSO60931 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CTNSO60931 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTNSO60931 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTNSO60931 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTNSO60931 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTNSO60931 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTNSO60931 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTNSO60931 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTNSO60931 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CTNSO60931 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTNSO60931 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTNSO60931 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTNSO60931 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
CTNSO60931 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
CTNSO60931 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.87
CTNSO60931 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CTNSO60931 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CTNSO60931 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CTNSO60931 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CTNSO60931 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CTNSO60931 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CTNSO60931 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CTNSO60931 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CTNSO60931 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CTNSO60931 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CTNSO60931 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTNSO60931 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTNSO60931 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTNSO60931 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTNSO60931 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTNSO60931 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTNSO60931 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTNSO60931 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTNSO60931 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTNSO60931 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTNSO60931 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTNSO60931 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTNSO60931 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTNSO60931 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTNSO60931 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTNSO60931 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTNSO60931 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTNSO60931 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTNSO60931 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTNSO60931 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTNSO60931 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTNSO60931 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTNSO60931 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTNSO60931 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTNSO60931 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTNSO60931 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CTNSO60931 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTNSO60931 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTNSO60931 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTNSO60931 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTNSO60931 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTNSO60931 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTNSO60931 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTNSO60931 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTNSO60931 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CTNSO60931 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CTNSO60931 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTNSO60931 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.7 ms