Protein–RNA interactions for Protein: O15254

ACOX3, Peroxisomal acyl-coenzyme A oxidase 3, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACOX3O15254 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ACOX3O15254 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ACOX3O15254 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ACOX3O15254 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ACOX3O15254 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ACOX3O15254 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ACOX3O15254 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ACOX3O15254 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ACOX3O15254 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ACOX3O15254 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ACOX3O15254 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ACOX3O15254 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ACOX3O15254 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ACOX3O15254 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ACOX3O15254 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
ACOX3O15254 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ACOX3O15254 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ACOX3O15254 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ACOX3O15254 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ACOX3O15254 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ACOX3O15254 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ACOX3O15254 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ACOX3O15254 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ACOX3O15254 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ACOX3O15254 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ACOX3O15254 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
ACOX3O15254 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ACOX3O15254 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ACOX3O15254 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ACOX3O15254 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ACOX3O15254 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ACOX3O15254 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ACOX3O15254 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ACOX3O15254 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ACOX3O15254 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ACOX3O15254 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ACOX3O15254 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ACOX3O15254 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ACOX3O15254 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ACOX3O15254 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ACOX3O15254 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ACOX3O15254 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ACOX3O15254 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ACOX3O15254 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ACOX3O15254 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ACOX3O15254 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ACOX3O15254 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ACOX3O15254 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ACOX3O15254 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ACOX3O15254 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ACOX3O15254 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ACOX3O15254 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ACOX3O15254 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ACOX3O15254 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ACOX3O15254 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ACOX3O15254 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ACOX3O15254 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
ACOX3O15254 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ACOX3O15254 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ACOX3O15254 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ACOX3O15254 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
ACOX3O15254 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ACOX3O15254 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ACOX3O15254 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ACOX3O15254 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ACOX3O15254 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ACOX3O15254 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ACOX3O15254 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ACOX3O15254 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ACOX3O15254 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ACOX3O15254 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ACOX3O15254 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ACOX3O15254 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ACOX3O15254 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ACOX3O15254 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ACOX3O15254 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ACOX3O15254 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ACOX3O15254 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
ACOX3O15254 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
ACOX3O15254 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ACOX3O15254 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ACOX3O15254 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ACOX3O15254 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ACOX3O15254 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ACOX3O15254 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ACOX3O15254 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ACOX3O15254 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ACOX3O15254 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ACOX3O15254 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ACOX3O15254 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ACOX3O15254 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ACOX3O15254 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ACOX3O15254 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ACOX3O15254 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ACOX3O15254 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ACOX3O15254 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ACOX3O15254 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ACOX3O15254 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ACOX3O15254 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ACOX3O15254 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms