Protein–RNA interactions for Protein: C9JSJ3

BHMG1, Basic helix-loop-helix and HMG box domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHMG1C9JSJ3 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
BHMG1C9JSJ3 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BHMG1C9JSJ3 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BHMG1C9JSJ3 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BHMG1C9JSJ3 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BHMG1C9JSJ3 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BHMG1C9JSJ3 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BHMG1C9JSJ3 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BHMG1C9JSJ3 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BHMG1C9JSJ3 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BHMG1C9JSJ3 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BHMG1C9JSJ3 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BHMG1C9JSJ3 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BHMG1C9JSJ3 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
BHMG1C9JSJ3 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BHMG1C9JSJ3 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BHMG1C9JSJ3 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BHMG1C9JSJ3 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BHMG1C9JSJ3 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
BHMG1C9JSJ3 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BHMG1C9JSJ3 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
BHMG1C9JSJ3 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
BHMG1C9JSJ3 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
BHMG1C9JSJ3 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BHMG1C9JSJ3 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BHMG1C9JSJ3 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
BHMG1C9JSJ3 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BHMG1C9JSJ3 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BHMG1C9JSJ3 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BHMG1C9JSJ3 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
BHMG1C9JSJ3 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
BHMG1C9JSJ3 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
BHMG1C9JSJ3 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BHMG1C9JSJ3 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BHMG1C9JSJ3 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BHMG1C9JSJ3 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
BHMG1C9JSJ3 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BHMG1C9JSJ3 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BHMG1C9JSJ3 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
BHMG1C9JSJ3 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
BHMG1C9JSJ3 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
BHMG1C9JSJ3 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
BHMG1C9JSJ3 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BHMG1C9JSJ3 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BHMG1C9JSJ3 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
BHMG1C9JSJ3 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
BHMG1C9JSJ3 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BHMG1C9JSJ3 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BHMG1C9JSJ3 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
BHMG1C9JSJ3 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
BHMG1C9JSJ3 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
BHMG1C9JSJ3 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BHMG1C9JSJ3 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
BHMG1C9JSJ3 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
BHMG1C9JSJ3 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
BHMG1C9JSJ3 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
BHMG1C9JSJ3 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
BHMG1C9JSJ3 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BHMG1C9JSJ3 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BHMG1C9JSJ3 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BHMG1C9JSJ3 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BHMG1C9JSJ3 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BHMG1C9JSJ3 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BHMG1C9JSJ3 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BHMG1C9JSJ3 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BHMG1C9JSJ3 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BHMG1C9JSJ3 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.19
BHMG1C9JSJ3 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
BHMG1C9JSJ3 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BHMG1C9JSJ3 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BHMG1C9JSJ3 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BHMG1C9JSJ3 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BHMG1C9JSJ3 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BHMG1C9JSJ3 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BHMG1C9JSJ3 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BHMG1C9JSJ3 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BHMG1C9JSJ3 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BHMG1C9JSJ3 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BHMG1C9JSJ3 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
BHMG1C9JSJ3 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BHMG1C9JSJ3 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BHMG1C9JSJ3 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BHMG1C9JSJ3 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BHMG1C9JSJ3 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BHMG1C9JSJ3 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BHMG1C9JSJ3 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BHMG1C9JSJ3 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BHMG1C9JSJ3 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BHMG1C9JSJ3 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BHMG1C9JSJ3 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BHMG1C9JSJ3 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
BHMG1C9JSJ3 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BHMG1C9JSJ3 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BHMG1C9JSJ3 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BHMG1C9JSJ3 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BHMG1C9JSJ3 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BHMG1C9JSJ3 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BHMG1C9JSJ3 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BHMG1C9JSJ3 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BHMG1C9JSJ3 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms