Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YYF1

TRBV7-4, T-cell receptor beta variable 7-4 (gene/pseudogene) (Fragment), humanhuman

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Length 115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TRBV7-4A0A0J9YYF1 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
TRBV7-4A0A0J9YYF1 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
TRBV7-4A0A0J9YYF1 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TRBV7-4A0A0J9YYF1 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TRBV7-4A0A0J9YYF1 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TRBV7-4A0A0J9YYF1 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
TRBV7-4A0A0J9YYF1 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TRBV7-4A0A0J9YYF1 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TRBV7-4A0A0J9YYF1 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
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