Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5E3

PCDHB6, Protocadherin beta-6, humanhuman

Predictions only

Length 794 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB6Q9Y5E3 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PCDHB6Q9Y5E3 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PCDHB6Q9Y5E3 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PCDHB6Q9Y5E3 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PCDHB6Q9Y5E3 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PCDHB6Q9Y5E3 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PCDHB6Q9Y5E3 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PCDHB6Q9Y5E3 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PCDHB6Q9Y5E3 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PCDHB6Q9Y5E3 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
PCDHB6Q9Y5E3 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
PCDHB6Q9Y5E3 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PCDHB6Q9Y5E3 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PCDHB6Q9Y5E3 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PCDHB6Q9Y5E3 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PCDHB6Q9Y5E3 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PCDHB6Q9Y5E3 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PCDHB6Q9Y5E3 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PCDHB6Q9Y5E3 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PCDHB6Q9Y5E3 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PCDHB6Q9Y5E3 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PCDHB6Q9Y5E3 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PCDHB6Q9Y5E3 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PCDHB6Q9Y5E3 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PCDHB6Q9Y5E3 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PCDHB6Q9Y5E3 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PCDHB6Q9Y5E3 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PCDHB6Q9Y5E3 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PCDHB6Q9Y5E3 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PCDHB6Q9Y5E3 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PCDHB6Q9Y5E3 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PCDHB6Q9Y5E3 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PCDHB6Q9Y5E3 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PCDHB6Q9Y5E3 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PCDHB6Q9Y5E3 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PCDHB6Q9Y5E3 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PCDHB6Q9Y5E3 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PCDHB6Q9Y5E3 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PCDHB6Q9Y5E3 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PCDHB6Q9Y5E3 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PCDHB6Q9Y5E3 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PCDHB6Q9Y5E3 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PCDHB6Q9Y5E3 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PCDHB6Q9Y5E3 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PCDHB6Q9Y5E3 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
PCDHB6Q9Y5E3 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PCDHB6Q9Y5E3 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PCDHB6Q9Y5E3 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PCDHB6Q9Y5E3 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PCDHB6Q9Y5E3 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PCDHB6Q9Y5E3 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PCDHB6Q9Y5E3 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PCDHB6Q9Y5E3 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PCDHB6Q9Y5E3 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PCDHB6Q9Y5E3 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PCDHB6Q9Y5E3 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PCDHB6Q9Y5E3 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
PCDHB6Q9Y5E3 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PCDHB6Q9Y5E3 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PCDHB6Q9Y5E3 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PCDHB6Q9Y5E3 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PCDHB6Q9Y5E3 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
PCDHB6Q9Y5E3 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PCDHB6Q9Y5E3 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PCDHB6Q9Y5E3 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PCDHB6Q9Y5E3 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PCDHB6Q9Y5E3 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PCDHB6Q9Y5E3 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PCDHB6Q9Y5E3 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PCDHB6Q9Y5E3 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PCDHB6Q9Y5E3 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PCDHB6Q9Y5E3 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PCDHB6Q9Y5E3 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PCDHB6Q9Y5E3 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PCDHB6Q9Y5E3 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PCDHB6Q9Y5E3 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PCDHB6Q9Y5E3 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PCDHB6Q9Y5E3 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PCDHB6Q9Y5E3 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PCDHB6Q9Y5E3 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PCDHB6Q9Y5E3 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
PCDHB6Q9Y5E3 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
PCDHB6Q9Y5E3 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PCDHB6Q9Y5E3 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PCDHB6Q9Y5E3 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PCDHB6Q9Y5E3 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PCDHB6Q9Y5E3 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PCDHB6Q9Y5E3 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PCDHB6Q9Y5E3 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PCDHB6Q9Y5E3 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PCDHB6Q9Y5E3 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
PCDHB6Q9Y5E3 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PCDHB6Q9Y5E3 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PCDHB6Q9Y5E3 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PCDHB6Q9Y5E3 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PCDHB6Q9Y5E3 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PCDHB6Q9Y5E3 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PCDHB6Q9Y5E3 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PCDHB6Q9Y5E3 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PCDHB6Q9Y5E3 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms