Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y597

KCTD3, BTB/POZ domain-containing protein KCTD3, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCTD3Q9Y597 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KCTD3Q9Y597 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
KCTD3Q9Y597 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
KCTD3Q9Y597 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
KCTD3Q9Y597 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KCTD3Q9Y597 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KCTD3Q9Y597 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KCTD3Q9Y597 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KCTD3Q9Y597 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KCTD3Q9Y597 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KCTD3Q9Y597 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCTD3Q9Y597 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCTD3Q9Y597 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCTD3Q9Y597 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCTD3Q9Y597 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCTD3Q9Y597 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCTD3Q9Y597 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCTD3Q9Y597 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCTD3Q9Y597 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCTD3Q9Y597 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCTD3Q9Y597 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCTD3Q9Y597 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCTD3Q9Y597 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCTD3Q9Y597 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCTD3Q9Y597 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCTD3Q9Y597 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCTD3Q9Y597 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCTD3Q9Y597 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KCTD3Q9Y597 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KCTD3Q9Y597 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KCTD3Q9Y597 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KCTD3Q9Y597 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KCTD3Q9Y597 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KCTD3Q9Y597 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KCTD3Q9Y597 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KCTD3Q9Y597 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KCTD3Q9Y597 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
KCTD3Q9Y597 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KCTD3Q9Y597 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KCTD3Q9Y597 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KCTD3Q9Y597 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KCTD3Q9Y597 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
KCTD3Q9Y597 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KCTD3Q9Y597 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
KCTD3Q9Y597 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KCTD3Q9Y597 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KCTD3Q9Y597 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KCTD3Q9Y597 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KCTD3Q9Y597 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KCTD3Q9Y597 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KCTD3Q9Y597 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KCTD3Q9Y597 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KCTD3Q9Y597 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KCTD3Q9Y597 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KCTD3Q9Y597 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KCTD3Q9Y597 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
KCTD3Q9Y597 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KCTD3Q9Y597 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KCTD3Q9Y597 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
KCTD3Q9Y597 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KCTD3Q9Y597 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KCTD3Q9Y597 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KCTD3Q9Y597 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KCTD3Q9Y597 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KCTD3Q9Y597 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KCTD3Q9Y597 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KCTD3Q9Y597 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KCTD3Q9Y597 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KCTD3Q9Y597 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
KCTD3Q9Y597 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KCTD3Q9Y597 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
KCTD3Q9Y597 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
KCTD3Q9Y597 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
KCTD3Q9Y597 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KCTD3Q9Y597 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KCTD3Q9Y597 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KCTD3Q9Y597 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KCTD3Q9Y597 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KCTD3Q9Y597 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
KCTD3Q9Y597 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KCTD3Q9Y597 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
KCTD3Q9Y597 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KCTD3Q9Y597 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
KCTD3Q9Y597 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
KCTD3Q9Y597 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KCTD3Q9Y597 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KCTD3Q9Y597 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
KCTD3Q9Y597 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KCTD3Q9Y597 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KCTD3Q9Y597 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
KCTD3Q9Y597 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
KCTD3Q9Y597 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KCTD3Q9Y597 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KCTD3Q9Y597 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KCTD3Q9Y597 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KCTD3Q9Y597 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KCTD3Q9Y597 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KCTD3Q9Y597 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KCTD3Q9Y597 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KCTD3Q9Y597 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.1 ms