Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y561

LRP12, Low-density lipoprotein receptor-related protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP12Q9Y561 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
LRP12Q9Y561 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
LRP12Q9Y561 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
LRP12Q9Y561 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
LRP12Q9Y561 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
LRP12Q9Y561 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
LRP12Q9Y561 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
LRP12Q9Y561 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
LRP12Q9Y561 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
LRP12Q9Y561 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
LRP12Q9Y561 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
LRP12Q9Y561 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
LRP12Q9Y561 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
LRP12Q9Y561 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
LRP12Q9Y561 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
LRP12Q9Y561 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
LRP12Q9Y561 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
LRP12Q9Y561 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
LRP12Q9Y561 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
LRP12Q9Y561 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
LRP12Q9Y561 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
LRP12Q9Y561 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
LRP12Q9Y561 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
LRP12Q9Y561 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
LRP12Q9Y561 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
LRP12Q9Y561 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
LRP12Q9Y561 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
LRP12Q9Y561 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
LRP12Q9Y561 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
LRP12Q9Y561 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
LRP12Q9Y561 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
LRP12Q9Y561 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
LRP12Q9Y561 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
LRP12Q9Y561 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
LRP12Q9Y561 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
LRP12Q9Y561 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
LRP12Q9Y561 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
LRP12Q9Y561 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
LRP12Q9Y561 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
LRP12Q9Y561 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
LRP12Q9Y561 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LRP12Q9Y561 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LRP12Q9Y561 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
LRP12Q9Y561 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LRP12Q9Y561 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LRP12Q9Y561 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LRP12Q9Y561 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
LRP12Q9Y561 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LRP12Q9Y561 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
LRP12Q9Y561 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LRP12Q9Y561 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LRP12Q9Y561 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
LRP12Q9Y561 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LRP12Q9Y561 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
LRP12Q9Y561 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
LRP12Q9Y561 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LRP12Q9Y561 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LRP12Q9Y561 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LRP12Q9Y561 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
LRP12Q9Y561 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
LRP12Q9Y561 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
LRP12Q9Y561 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
LRP12Q9Y561 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
LRP12Q9Y561 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
LRP12Q9Y561 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
LRP12Q9Y561 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
LRP12Q9Y561 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LRP12Q9Y561 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
LRP12Q9Y561 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
LRP12Q9Y561 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
LRP12Q9Y561 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
LRP12Q9Y561 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
LRP12Q9Y561 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LRP12Q9Y561 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LRP12Q9Y561 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LRP12Q9Y561 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LRP12Q9Y561 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LRP12Q9Y561 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
LRP12Q9Y561 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
LRP12Q9Y561 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
LRP12Q9Y561 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LRP12Q9Y561 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LRP12Q9Y561 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
LRP12Q9Y561 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LRP12Q9Y561 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LRP12Q9Y561 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LRP12Q9Y561 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
LRP12Q9Y561 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LRP12Q9Y561 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LRP12Q9Y561 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LRP12Q9Y561 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LRP12Q9Y561 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LRP12Q9Y561 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LRP12Q9Y561 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LRP12Q9Y561 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
LRP12Q9Y561 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LRP12Q9Y561 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
LRP12Q9Y561 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
LRP12Q9Y561 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
LRP12Q9Y561 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms