Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKT9

IKZF3, Zinc finger protein Aiolos, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IKZF3Q9UKT9 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
IKZF3Q9UKT9 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
IKZF3Q9UKT9 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
IKZF3Q9UKT9 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
IKZF3Q9UKT9 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
IKZF3Q9UKT9 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
IKZF3Q9UKT9 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
IKZF3Q9UKT9 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
IKZF3Q9UKT9 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
IKZF3Q9UKT9 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
IKZF3Q9UKT9 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
IKZF3Q9UKT9 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
IKZF3Q9UKT9 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
IKZF3Q9UKT9 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
IKZF3Q9UKT9 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
IKZF3Q9UKT9 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
IKZF3Q9UKT9 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
IKZF3Q9UKT9 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
IKZF3Q9UKT9 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
IKZF3Q9UKT9 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
IKZF3Q9UKT9 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
IKZF3Q9UKT9 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
IKZF3Q9UKT9 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
IKZF3Q9UKT9 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
IKZF3Q9UKT9 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
IKZF3Q9UKT9 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
IKZF3Q9UKT9 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
IKZF3Q9UKT9 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
IKZF3Q9UKT9 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
IKZF3Q9UKT9 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
IKZF3Q9UKT9 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
IKZF3Q9UKT9 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
IKZF3Q9UKT9 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
IKZF3Q9UKT9 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
IKZF3Q9UKT9 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
IKZF3Q9UKT9 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
IKZF3Q9UKT9 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
IKZF3Q9UKT9 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
IKZF3Q9UKT9 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
IKZF3Q9UKT9 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
IKZF3Q9UKT9 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
IKZF3Q9UKT9 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
IKZF3Q9UKT9 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
IKZF3Q9UKT9 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
IKZF3Q9UKT9 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
IKZF3Q9UKT9 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
IKZF3Q9UKT9 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
IKZF3Q9UKT9 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
IKZF3Q9UKT9 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
IKZF3Q9UKT9 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
IKZF3Q9UKT9 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
IKZF3Q9UKT9 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
IKZF3Q9UKT9 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
IKZF3Q9UKT9 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
IKZF3Q9UKT9 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
IKZF3Q9UKT9 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
IKZF3Q9UKT9 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
IKZF3Q9UKT9 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
IKZF3Q9UKT9 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
IKZF3Q9UKT9 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
IKZF3Q9UKT9 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
IKZF3Q9UKT9 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
IKZF3Q9UKT9 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
IKZF3Q9UKT9 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
IKZF3Q9UKT9 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
IKZF3Q9UKT9 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
IKZF3Q9UKT9 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
IKZF3Q9UKT9 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
IKZF3Q9UKT9 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
IKZF3Q9UKT9 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
IKZF3Q9UKT9 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
IKZF3Q9UKT9 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
IKZF3Q9UKT9 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
IKZF3Q9UKT9 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
IKZF3Q9UKT9 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
IKZF3Q9UKT9 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
IKZF3Q9UKT9 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
IKZF3Q9UKT9 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
IKZF3Q9UKT9 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
IKZF3Q9UKT9 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
IKZF3Q9UKT9 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
IKZF3Q9UKT9 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
IKZF3Q9UKT9 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
IKZF3Q9UKT9 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
IKZF3Q9UKT9 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
IKZF3Q9UKT9 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
IKZF3Q9UKT9 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
IKZF3Q9UKT9 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
IKZF3Q9UKT9 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
IKZF3Q9UKT9 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
IKZF3Q9UKT9 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
IKZF3Q9UKT9 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
IKZF3Q9UKT9 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
IKZF3Q9UKT9 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
IKZF3Q9UKT9 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
IKZF3Q9UKT9 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
IKZF3Q9UKT9 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
IKZF3Q9UKT9 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
IKZF3Q9UKT9 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
IKZF3Q9UKT9 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.4 ms