Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBF2

COPG2, Coatomer subunit gamma-2, humanhuman

Predictions only

Length 871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPG2Q9UBF2 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
COPG2Q9UBF2 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
COPG2Q9UBF2 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
COPG2Q9UBF2 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
COPG2Q9UBF2 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
COPG2Q9UBF2 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
COPG2Q9UBF2 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
COPG2Q9UBF2 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
COPG2Q9UBF2 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
COPG2Q9UBF2 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
COPG2Q9UBF2 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
COPG2Q9UBF2 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
COPG2Q9UBF2 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
COPG2Q9UBF2 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
COPG2Q9UBF2 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
COPG2Q9UBF2 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
COPG2Q9UBF2 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
COPG2Q9UBF2 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
COPG2Q9UBF2 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
COPG2Q9UBF2 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
COPG2Q9UBF2 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
COPG2Q9UBF2 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
COPG2Q9UBF2 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
COPG2Q9UBF2 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
COPG2Q9UBF2 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
COPG2Q9UBF2 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
COPG2Q9UBF2 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
COPG2Q9UBF2 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
COPG2Q9UBF2 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
COPG2Q9UBF2 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
COPG2Q9UBF2 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
COPG2Q9UBF2 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
COPG2Q9UBF2 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
COPG2Q9UBF2 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
COPG2Q9UBF2 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
COPG2Q9UBF2 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
COPG2Q9UBF2 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
COPG2Q9UBF2 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
COPG2Q9UBF2 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
COPG2Q9UBF2 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
COPG2Q9UBF2 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
COPG2Q9UBF2 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
COPG2Q9UBF2 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
COPG2Q9UBF2 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
COPG2Q9UBF2 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
COPG2Q9UBF2 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
COPG2Q9UBF2 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
COPG2Q9UBF2 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
COPG2Q9UBF2 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
COPG2Q9UBF2 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
COPG2Q9UBF2 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
COPG2Q9UBF2 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
COPG2Q9UBF2 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
COPG2Q9UBF2 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
COPG2Q9UBF2 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
COPG2Q9UBF2 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
COPG2Q9UBF2 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
COPG2Q9UBF2 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
COPG2Q9UBF2 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
COPG2Q9UBF2 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
COPG2Q9UBF2 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
COPG2Q9UBF2 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
COPG2Q9UBF2 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
COPG2Q9UBF2 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
COPG2Q9UBF2 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
COPG2Q9UBF2 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
COPG2Q9UBF2 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
COPG2Q9UBF2 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
COPG2Q9UBF2 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
COPG2Q9UBF2 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
COPG2Q9UBF2 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
COPG2Q9UBF2 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
COPG2Q9UBF2 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
COPG2Q9UBF2 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
COPG2Q9UBF2 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
COPG2Q9UBF2 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
COPG2Q9UBF2 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
COPG2Q9UBF2 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
COPG2Q9UBF2 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
COPG2Q9UBF2 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
COPG2Q9UBF2 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
COPG2Q9UBF2 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
COPG2Q9UBF2 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
COPG2Q9UBF2 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
COPG2Q9UBF2 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
COPG2Q9UBF2 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
COPG2Q9UBF2 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
COPG2Q9UBF2 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
COPG2Q9UBF2 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
COPG2Q9UBF2 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
COPG2Q9UBF2 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
COPG2Q9UBF2 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
COPG2Q9UBF2 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
COPG2Q9UBF2 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
COPG2Q9UBF2 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
COPG2Q9UBF2 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
COPG2Q9UBF2 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
COPG2Q9UBF2 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
COPG2Q9UBF2 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
COPG2Q9UBF2 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.4 ms