Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYV4

CDK12, Cyclin-dependent kinase 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK12Q9NYV4 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
CDK12Q9NYV4 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
CDK12Q9NYV4 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
CDK12Q9NYV4 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
CDK12Q9NYV4 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
CDK12Q9NYV4 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
CDK12Q9NYV4 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
CDK12Q9NYV4 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
CDK12Q9NYV4 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
CDK12Q9NYV4 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
CDK12Q9NYV4 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
CDK12Q9NYV4 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
CDK12Q9NYV4 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
CDK12Q9NYV4 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
CDK12Q9NYV4 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
CDK12Q9NYV4 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
CDK12Q9NYV4 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
CDK12Q9NYV4 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
CDK12Q9NYV4 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
CDK12Q9NYV4 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
CDK12Q9NYV4 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
CDK12Q9NYV4 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
CDK12Q9NYV4 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
CDK12Q9NYV4 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC30.1■■■□□ 2.41
CDK12Q9NYV4 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
CDK12Q9NYV4 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
CDK12Q9NYV4 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
CDK12Q9NYV4 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
CDK12Q9NYV4 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
CDK12Q9NYV4 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
CDK12Q9NYV4 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
CDK12Q9NYV4 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
CDK12Q9NYV4 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
CDK12Q9NYV4 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
CDK12Q9NYV4 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
CDK12Q9NYV4 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
CDK12Q9NYV4 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
CDK12Q9NYV4 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
CDK12Q9NYV4 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CDK12Q9NYV4 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CDK12Q9NYV4 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CDK12Q9NYV4 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
CDK12Q9NYV4 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC30.08■■■□□ 2.41
CDK12Q9NYV4 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC30.08■■■□□ 2.41
CDK12Q9NYV4 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CDK12Q9NYV4 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CDK12Q9NYV4 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
CDK12Q9NYV4 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
CDK12Q9NYV4 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CDK12Q9NYV4 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
CDK12Q9NYV4 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC30.07■■■□□ 2.4
CDK12Q9NYV4 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
CDK12Q9NYV4 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
CDK12Q9NYV4 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CDK12Q9NYV4 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CDK12Q9NYV4 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
CDK12Q9NYV4 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
CDK12Q9NYV4 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CDK12Q9NYV4 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CDK12Q9NYV4 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
CDK12Q9NYV4 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CDK12Q9NYV4 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
CDK12Q9NYV4 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CDK12Q9NYV4 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CDK12Q9NYV4 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CDK12Q9NYV4 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
CDK12Q9NYV4 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CDK12Q9NYV4 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CDK12Q9NYV4 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CDK12Q9NYV4 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CDK12Q9NYV4 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CDK12Q9NYV4 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
CDK12Q9NYV4 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CDK12Q9NYV4 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CDK12Q9NYV4 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
CDK12Q9NYV4 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
CDK12Q9NYV4 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
CDK12Q9NYV4 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
CDK12Q9NYV4 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
CDK12Q9NYV4 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CDK12Q9NYV4 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
CDK12Q9NYV4 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
CDK12Q9NYV4 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
CDK12Q9NYV4 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CDK12Q9NYV4 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CDK12Q9NYV4 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CDK12Q9NYV4 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CDK12Q9NYV4 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CDK12Q9NYV4 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
CDK12Q9NYV4 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
CDK12Q9NYV4 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CDK12Q9NYV4 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
CDK12Q9NYV4 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
CDK12Q9NYV4 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
CDK12Q9NYV4 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CDK12Q9NYV4 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC30.03■■■□□ 2.4
CDK12Q9NYV4 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CDK12Q9NYV4 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
CDK12Q9NYV4 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
CDK12Q9NYV4 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73 ms