Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY71

LRRC3, Leucine-rich repeat-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC3Q9BY71 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LRRC3Q9BY71 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRRC3Q9BY71 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRRC3Q9BY71 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRRC3Q9BY71 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRRC3Q9BY71 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRRC3Q9BY71 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRRC3Q9BY71 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRRC3Q9BY71 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRRC3Q9BY71 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRRC3Q9BY71 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRRC3Q9BY71 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRRC3Q9BY71 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRRC3Q9BY71 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRRC3Q9BY71 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRRC3Q9BY71 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRRC3Q9BY71 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRRC3Q9BY71 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRRC3Q9BY71 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRRC3Q9BY71 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRRC3Q9BY71 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRRC3Q9BY71 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRRC3Q9BY71 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRRC3Q9BY71 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRRC3Q9BY71 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRRC3Q9BY71 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRRC3Q9BY71 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
LRRC3Q9BY71 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRRC3Q9BY71 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRRC3Q9BY71 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRC3Q9BY71 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRC3Q9BY71 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRC3Q9BY71 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRC3Q9BY71 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRC3Q9BY71 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRC3Q9BY71 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRC3Q9BY71 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRC3Q9BY71 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRRC3Q9BY71 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRRC3Q9BY71 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRRC3Q9BY71 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRRC3Q9BY71 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRRC3Q9BY71 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRRC3Q9BY71 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRRC3Q9BY71 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRC3Q9BY71 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRC3Q9BY71 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRC3Q9BY71 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRC3Q9BY71 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRC3Q9BY71 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRC3Q9BY71 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRC3Q9BY71 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRC3Q9BY71 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRC3Q9BY71 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRC3Q9BY71 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRC3Q9BY71 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRC3Q9BY71 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRC3Q9BY71 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRC3Q9BY71 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRC3Q9BY71 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRC3Q9BY71 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRC3Q9BY71 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRC3Q9BY71 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRC3Q9BY71 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRC3Q9BY71 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRC3Q9BY71 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRC3Q9BY71 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRC3Q9BY71 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRC3Q9BY71 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRC3Q9BY71 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRC3Q9BY71 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRC3Q9BY71 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRC3Q9BY71 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRC3Q9BY71 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRC3Q9BY71 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRC3Q9BY71 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRC3Q9BY71 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRC3Q9BY71 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRC3Q9BY71 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRC3Q9BY71 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRC3Q9BY71 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRC3Q9BY71 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRC3Q9BY71 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRC3Q9BY71 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRC3Q9BY71 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRC3Q9BY71 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRC3Q9BY71 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRC3Q9BY71 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRC3Q9BY71 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRC3Q9BY71 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRC3Q9BY71 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRC3Q9BY71 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRC3Q9BY71 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRC3Q9BY71 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRC3Q9BY71 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRC3Q9BY71 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRRC3Q9BY71 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRRC3Q9BY71 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRRC3Q9BY71 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRRC3Q9BY71 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.7 ms