Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUP0

EFHD1, EF-hand domain-containing protein D1, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFHD1Q9BUP0 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EFHD1Q9BUP0 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
EFHD1Q9BUP0 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EFHD1Q9BUP0 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EFHD1Q9BUP0 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EFHD1Q9BUP0 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EFHD1Q9BUP0 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EFHD1Q9BUP0 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EFHD1Q9BUP0 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EFHD1Q9BUP0 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EFHD1Q9BUP0 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EFHD1Q9BUP0 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EFHD1Q9BUP0 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EFHD1Q9BUP0 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
EFHD1Q9BUP0 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
EFHD1Q9BUP0 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
EFHD1Q9BUP0 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
EFHD1Q9BUP0 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
EFHD1Q9BUP0 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
EFHD1Q9BUP0 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
EFHD1Q9BUP0 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
EFHD1Q9BUP0 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
EFHD1Q9BUP0 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
EFHD1Q9BUP0 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
EFHD1Q9BUP0 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
EFHD1Q9BUP0 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.04
EFHD1Q9BUP0 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EFHD1Q9BUP0 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EFHD1Q9BUP0 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EFHD1Q9BUP0 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EFHD1Q9BUP0 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EFHD1Q9BUP0 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EFHD1Q9BUP0 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EFHD1Q9BUP0 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EFHD1Q9BUP0 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EFHD1Q9BUP0 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EFHD1Q9BUP0 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EFHD1Q9BUP0 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EFHD1Q9BUP0 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EFHD1Q9BUP0 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EFHD1Q9BUP0 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EFHD1Q9BUP0 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EFHD1Q9BUP0 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EFHD1Q9BUP0 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EFHD1Q9BUP0 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EFHD1Q9BUP0 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EFHD1Q9BUP0 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EFHD1Q9BUP0 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EFHD1Q9BUP0 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EFHD1Q9BUP0 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EFHD1Q9BUP0 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EFHD1Q9BUP0 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EFHD1Q9BUP0 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
EFHD1Q9BUP0 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EFHD1Q9BUP0 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EFHD1Q9BUP0 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EFHD1Q9BUP0 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EFHD1Q9BUP0 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
EFHD1Q9BUP0 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
EFHD1Q9BUP0 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EFHD1Q9BUP0 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EFHD1Q9BUP0 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
EFHD1Q9BUP0 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
EFHD1Q9BUP0 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
EFHD1Q9BUP0 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EFHD1Q9BUP0 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
EFHD1Q9BUP0 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EFHD1Q9BUP0 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EFHD1Q9BUP0 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EFHD1Q9BUP0 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EFHD1Q9BUP0 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EFHD1Q9BUP0 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EFHD1Q9BUP0 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EFHD1Q9BUP0 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EFHD1Q9BUP0 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EFHD1Q9BUP0 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EFHD1Q9BUP0 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
EFHD1Q9BUP0 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EFHD1Q9BUP0 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
EFHD1Q9BUP0 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
EFHD1Q9BUP0 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
EFHD1Q9BUP0 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EFHD1Q9BUP0 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
EFHD1Q9BUP0 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EFHD1Q9BUP0 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EFHD1Q9BUP0 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EFHD1Q9BUP0 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EFHD1Q9BUP0 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EFHD1Q9BUP0 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EFHD1Q9BUP0 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EFHD1Q9BUP0 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EFHD1Q9BUP0 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EFHD1Q9BUP0 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
EFHD1Q9BUP0 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
EFHD1Q9BUP0 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EFHD1Q9BUP0 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
EFHD1Q9BUP0 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
EFHD1Q9BUP0 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
EFHD1Q9BUP0 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
EFHD1Q9BUP0 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.6 ms