Protein–RNA interactions for Protein: Q9BR61

ACBD6, Acyl-CoA-binding domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACBD6Q9BR61 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ACBD6Q9BR61 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ACBD6Q9BR61 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ACBD6Q9BR61 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ACBD6Q9BR61 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ACBD6Q9BR61 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ACBD6Q9BR61 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ACBD6Q9BR61 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ACBD6Q9BR61 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ACBD6Q9BR61 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ACBD6Q9BR61 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ACBD6Q9BR61 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ACBD6Q9BR61 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ACBD6Q9BR61 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ACBD6Q9BR61 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ACBD6Q9BR61 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ACBD6Q9BR61 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ACBD6Q9BR61 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ACBD6Q9BR61 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ACBD6Q9BR61 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ACBD6Q9BR61 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ACBD6Q9BR61 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
ACBD6Q9BR61 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ACBD6Q9BR61 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ACBD6Q9BR61 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ACBD6Q9BR61 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ACBD6Q9BR61 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ACBD6Q9BR61 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ACBD6Q9BR61 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ACBD6Q9BR61 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ACBD6Q9BR61 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ACBD6Q9BR61 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ACBD6Q9BR61 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
ACBD6Q9BR61 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ACBD6Q9BR61 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ACBD6Q9BR61 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ACBD6Q9BR61 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
ACBD6Q9BR61 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ACBD6Q9BR61 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ACBD6Q9BR61 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ACBD6Q9BR61 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ACBD6Q9BR61 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ACBD6Q9BR61 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ACBD6Q9BR61 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ACBD6Q9BR61 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ACBD6Q9BR61 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ACBD6Q9BR61 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ACBD6Q9BR61 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ACBD6Q9BR61 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ACBD6Q9BR61 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ACBD6Q9BR61 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ACBD6Q9BR61 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ACBD6Q9BR61 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ACBD6Q9BR61 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ACBD6Q9BR61 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ACBD6Q9BR61 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ACBD6Q9BR61 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ACBD6Q9BR61 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
ACBD6Q9BR61 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ACBD6Q9BR61 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ACBD6Q9BR61 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
ACBD6Q9BR61 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ACBD6Q9BR61 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ACBD6Q9BR61 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ACBD6Q9BR61 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ACBD6Q9BR61 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ACBD6Q9BR61 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ACBD6Q9BR61 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
ACBD6Q9BR61 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ACBD6Q9BR61 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ACBD6Q9BR61 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ACBD6Q9BR61 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ACBD6Q9BR61 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ACBD6Q9BR61 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ACBD6Q9BR61 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ACBD6Q9BR61 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ACBD6Q9BR61 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ACBD6Q9BR61 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ACBD6Q9BR61 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ACBD6Q9BR61 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ACBD6Q9BR61 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ACBD6Q9BR61 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ACBD6Q9BR61 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ACBD6Q9BR61 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ACBD6Q9BR61 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ACBD6Q9BR61 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ACBD6Q9BR61 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ACBD6Q9BR61 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ACBD6Q9BR61 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
ACBD6Q9BR61 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ACBD6Q9BR61 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ACBD6Q9BR61 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ACBD6Q9BR61 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ACBD6Q9BR61 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ACBD6Q9BR61 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
ACBD6Q9BR61 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ACBD6Q9BR61 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
ACBD6Q9BR61 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ACBD6Q9BR61 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ACBD6Q9BR61 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.2 ms