Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQQ3

GORASP1, Golgi reassembly-stacking protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GORASP1Q9BQQ3 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
GORASP1Q9BQQ3 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GORASP1Q9BQQ3 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GORASP1Q9BQQ3 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GORASP1Q9BQQ3 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GORASP1Q9BQQ3 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GORASP1Q9BQQ3 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GORASP1Q9BQQ3 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GORASP1Q9BQQ3 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GORASP1Q9BQQ3 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GORASP1Q9BQQ3 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
GORASP1Q9BQQ3 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GORASP1Q9BQQ3 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GORASP1Q9BQQ3 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GORASP1Q9BQQ3 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GORASP1Q9BQQ3 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GORASP1Q9BQQ3 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GORASP1Q9BQQ3 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GORASP1Q9BQQ3 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GORASP1Q9BQQ3 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GORASP1Q9BQQ3 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GORASP1Q9BQQ3 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GORASP1Q9BQQ3 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GORASP1Q9BQQ3 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
GORASP1Q9BQQ3 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GORASP1Q9BQQ3 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GORASP1Q9BQQ3 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GORASP1Q9BQQ3 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GORASP1Q9BQQ3 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GORASP1Q9BQQ3 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
GORASP1Q9BQQ3 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
GORASP1Q9BQQ3 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
GORASP1Q9BQQ3 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
GORASP1Q9BQQ3 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GORASP1Q9BQQ3 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GORASP1Q9BQQ3 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GORASP1Q9BQQ3 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GORASP1Q9BQQ3 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GORASP1Q9BQQ3 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GORASP1Q9BQQ3 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GORASP1Q9BQQ3 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GORASP1Q9BQQ3 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GORASP1Q9BQQ3 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GORASP1Q9BQQ3 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GORASP1Q9BQQ3 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
GORASP1Q9BQQ3 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GORASP1Q9BQQ3 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
GORASP1Q9BQQ3 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GORASP1Q9BQQ3 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GORASP1Q9BQQ3 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GORASP1Q9BQQ3 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GORASP1Q9BQQ3 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GORASP1Q9BQQ3 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GORASP1Q9BQQ3 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GORASP1Q9BQQ3 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GORASP1Q9BQQ3 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GORASP1Q9BQQ3 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GORASP1Q9BQQ3 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
GORASP1Q9BQQ3 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GORASP1Q9BQQ3 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GORASP1Q9BQQ3 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GORASP1Q9BQQ3 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GORASP1Q9BQQ3 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GORASP1Q9BQQ3 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
GORASP1Q9BQQ3 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GORASP1Q9BQQ3 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GORASP1Q9BQQ3 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GORASP1Q9BQQ3 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GORASP1Q9BQQ3 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GORASP1Q9BQQ3 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GORASP1Q9BQQ3 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GORASP1Q9BQQ3 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GORASP1Q9BQQ3 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GORASP1Q9BQQ3 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GORASP1Q9BQQ3 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
GORASP1Q9BQQ3 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GORASP1Q9BQQ3 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GORASP1Q9BQQ3 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GORASP1Q9BQQ3 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GORASP1Q9BQQ3 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GORASP1Q9BQQ3 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GORASP1Q9BQQ3 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GORASP1Q9BQQ3 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GORASP1Q9BQQ3 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GORASP1Q9BQQ3 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GORASP1Q9BQQ3 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GORASP1Q9BQQ3 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GORASP1Q9BQQ3 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GORASP1Q9BQQ3 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GORASP1Q9BQQ3 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GORASP1Q9BQQ3 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
GORASP1Q9BQQ3 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GORASP1Q9BQQ3 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GORASP1Q9BQQ3 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GORASP1Q9BQQ3 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GORASP1Q9BQQ3 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GORASP1Q9BQQ3 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GORASP1Q9BQQ3 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GORASP1Q9BQQ3 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GORASP1Q9BQQ3 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.7 ms