Protein–RNA interactions for Protein: Q99967

CITED2, Cbp/p300-interacting transactivator 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED2Q99967 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CITED2Q99967 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CITED2Q99967 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CITED2Q99967 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CITED2Q99967 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CITED2Q99967 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CITED2Q99967 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CITED2Q99967 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CITED2Q99967 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CITED2Q99967 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CITED2Q99967 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CITED2Q99967 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CITED2Q99967 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CITED2Q99967 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CITED2Q99967 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CITED2Q99967 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CITED2Q99967 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CITED2Q99967 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CITED2Q99967 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CITED2Q99967 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CITED2Q99967 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CITED2Q99967 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CITED2Q99967 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CITED2Q99967 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CITED2Q99967 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CITED2Q99967 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CITED2Q99967 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CITED2Q99967 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CITED2Q99967 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CITED2Q99967 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CITED2Q99967 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CITED2Q99967 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CITED2Q99967 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CITED2Q99967 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CITED2Q99967 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CITED2Q99967 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CITED2Q99967 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CITED2Q99967 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CITED2Q99967 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CITED2Q99967 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CITED2Q99967 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CITED2Q99967 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CITED2Q99967 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CITED2Q99967 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CITED2Q99967 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CITED2Q99967 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CITED2Q99967 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CITED2Q99967 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CITED2Q99967 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CITED2Q99967 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CITED2Q99967 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CITED2Q99967 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CITED2Q99967 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CITED2Q99967 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CITED2Q99967 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CITED2Q99967 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CITED2Q99967 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CITED2Q99967 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CITED2Q99967 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CITED2Q99967 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CITED2Q99967 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CITED2Q99967 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CITED2Q99967 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CITED2Q99967 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CITED2Q99967 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CITED2Q99967 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CITED2Q99967 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CITED2Q99967 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CITED2Q99967 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CITED2Q99967 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CITED2Q99967 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CITED2Q99967 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CITED2Q99967 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CITED2Q99967 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CITED2Q99967 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CITED2Q99967 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CITED2Q99967 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CITED2Q99967 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CITED2Q99967 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CITED2Q99967 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CITED2Q99967 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CITED2Q99967 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CITED2Q99967 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CITED2Q99967 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CITED2Q99967 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CITED2Q99967 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CITED2Q99967 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CITED2Q99967 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CITED2Q99967 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CITED2Q99967 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CITED2Q99967 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CITED2Q99967 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CITED2Q99967 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CITED2Q99967 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CITED2Q99967 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CITED2Q99967 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CITED2Q99967 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CITED2Q99967 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CITED2Q99967 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CITED2Q99967 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.8 ms