Protein–RNA interactions for Protein: Q96HJ3

CCDC34, Coiled-coil domain-containing protein 34, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC34Q96HJ3 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC34Q96HJ3 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC34Q96HJ3 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC34Q96HJ3 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC34Q96HJ3 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC34Q96HJ3 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC34Q96HJ3 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC34Q96HJ3 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC34Q96HJ3 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC34Q96HJ3 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC34Q96HJ3 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC34Q96HJ3 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC34Q96HJ3 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC34Q96HJ3 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC34Q96HJ3 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC34Q96HJ3 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC34Q96HJ3 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC34Q96HJ3 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC34Q96HJ3 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC34Q96HJ3 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC34Q96HJ3 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC34Q96HJ3 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC34Q96HJ3 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC34Q96HJ3 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC34Q96HJ3 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC34Q96HJ3 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC34Q96HJ3 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC34Q96HJ3 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC34Q96HJ3 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC34Q96HJ3 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC34Q96HJ3 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC34Q96HJ3 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC34Q96HJ3 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC34Q96HJ3 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC34Q96HJ3 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC34Q96HJ3 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC34Q96HJ3 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC34Q96HJ3 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC34Q96HJ3 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC34Q96HJ3 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC34Q96HJ3 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC34Q96HJ3 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC34Q96HJ3 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC34Q96HJ3 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC34Q96HJ3 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC34Q96HJ3 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC34Q96HJ3 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC34Q96HJ3 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC34Q96HJ3 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC34Q96HJ3 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC34Q96HJ3 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC34Q96HJ3 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC34Q96HJ3 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC34Q96HJ3 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC34Q96HJ3 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC34Q96HJ3 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC34Q96HJ3 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC34Q96HJ3 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC34Q96HJ3 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC34Q96HJ3 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC34Q96HJ3 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC34Q96HJ3 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC34Q96HJ3 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC34Q96HJ3 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC34Q96HJ3 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC34Q96HJ3 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC34Q96HJ3 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC34Q96HJ3 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC34Q96HJ3 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC34Q96HJ3 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC34Q96HJ3 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC34Q96HJ3 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC34Q96HJ3 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC34Q96HJ3 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC34Q96HJ3 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC34Q96HJ3 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC34Q96HJ3 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC34Q96HJ3 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC34Q96HJ3 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CCDC34Q96HJ3 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CCDC34Q96HJ3 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CCDC34Q96HJ3 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CCDC34Q96HJ3 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CCDC34Q96HJ3 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC34Q96HJ3 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC34Q96HJ3 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC34Q96HJ3 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC34Q96HJ3 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC34Q96HJ3 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC34Q96HJ3 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC34Q96HJ3 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC34Q96HJ3 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC34Q96HJ3 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC34Q96HJ3 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC34Q96HJ3 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC34Q96HJ3 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC34Q96HJ3 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC34Q96HJ3 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC34Q96HJ3 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC34Q96HJ3 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.1 ms