Protein–RNA interactions for Protein: Q96B42

TMEM18, Transmembrane protein 18, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM18Q96B42 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM18Q96B42 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM18Q96B42 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM18Q96B42 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM18Q96B42 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM18Q96B42 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM18Q96B42 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM18Q96B42 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM18Q96B42 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM18Q96B42 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM18Q96B42 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM18Q96B42 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM18Q96B42 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM18Q96B42 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM18Q96B42 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM18Q96B42 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM18Q96B42 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM18Q96B42 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM18Q96B42 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM18Q96B42 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM18Q96B42 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM18Q96B42 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM18Q96B42 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM18Q96B42 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM18Q96B42 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM18Q96B42 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM18Q96B42 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM18Q96B42 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM18Q96B42 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM18Q96B42 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM18Q96B42 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM18Q96B42 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM18Q96B42 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM18Q96B42 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM18Q96B42 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM18Q96B42 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM18Q96B42 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM18Q96B42 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM18Q96B42 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM18Q96B42 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM18Q96B42 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM18Q96B42 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TMEM18Q96B42 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TMEM18Q96B42 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TMEM18Q96B42 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TMEM18Q96B42 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TMEM18Q96B42 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM18Q96B42 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM18Q96B42 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM18Q96B42 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM18Q96B42 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM18Q96B42 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM18Q96B42 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM18Q96B42 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM18Q96B42 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM18Q96B42 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM18Q96B42 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM18Q96B42 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM18Q96B42 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM18Q96B42 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM18Q96B42 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM18Q96B42 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM18Q96B42 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM18Q96B42 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM18Q96B42 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM18Q96B42 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM18Q96B42 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM18Q96B42 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM18Q96B42 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM18Q96B42 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM18Q96B42 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM18Q96B42 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM18Q96B42 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM18Q96B42 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM18Q96B42 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM18Q96B42 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM18Q96B42 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM18Q96B42 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM18Q96B42 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM18Q96B42 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM18Q96B42 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM18Q96B42 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM18Q96B42 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM18Q96B42 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM18Q96B42 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM18Q96B42 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM18Q96B42 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM18Q96B42 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM18Q96B42 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM18Q96B42 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM18Q96B42 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM18Q96B42 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM18Q96B42 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM18Q96B42 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM18Q96B42 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM18Q96B42 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM18Q96B42 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM18Q96B42 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM18Q96B42 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM18Q96B42 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.2 ms