Protein–RNA interactions for Protein: Q96A33

CCDC47, Coiled-coil domain-containing protein 47, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC47Q96A33 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC47Q96A33 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC47Q96A33 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC47Q96A33 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC47Q96A33 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC47Q96A33 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC47Q96A33 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC47Q96A33 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC47Q96A33 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC47Q96A33 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC47Q96A33 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC47Q96A33 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC47Q96A33 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC47Q96A33 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC47Q96A33 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC47Q96A33 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC47Q96A33 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC47Q96A33 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CCDC47Q96A33 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CCDC47Q96A33 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC47Q96A33 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC47Q96A33 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC47Q96A33 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC47Q96A33 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC47Q96A33 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC47Q96A33 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC47Q96A33 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC47Q96A33 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC47Q96A33 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC47Q96A33 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC47Q96A33 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC47Q96A33 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC47Q96A33 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC47Q96A33 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC47Q96A33 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC47Q96A33 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC47Q96A33 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC47Q96A33 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC47Q96A33 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC47Q96A33 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC47Q96A33 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC47Q96A33 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC47Q96A33 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC47Q96A33 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC47Q96A33 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC47Q96A33 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC47Q96A33 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC47Q96A33 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC47Q96A33 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC47Q96A33 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC47Q96A33 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC47Q96A33 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC47Q96A33 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC47Q96A33 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC47Q96A33 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC47Q96A33 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC47Q96A33 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC47Q96A33 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC47Q96A33 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC47Q96A33 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC47Q96A33 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC47Q96A33 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC47Q96A33 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC47Q96A33 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC47Q96A33 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC47Q96A33 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC47Q96A33 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC47Q96A33 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC47Q96A33 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC47Q96A33 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC47Q96A33 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC47Q96A33 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC47Q96A33 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC47Q96A33 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC47Q96A33 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC47Q96A33 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC47Q96A33 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC47Q96A33 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC47Q96A33 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC47Q96A33 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC47Q96A33 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC47Q96A33 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC47Q96A33 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC47Q96A33 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC47Q96A33 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC47Q96A33 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC47Q96A33 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC47Q96A33 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC47Q96A33 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC47Q96A33 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC47Q96A33 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC47Q96A33 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC47Q96A33 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC47Q96A33 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC47Q96A33 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC47Q96A33 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC47Q96A33 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC47Q96A33 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC47Q96A33 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC47Q96A33 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
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