Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMY6

WDR88, WD repeat-containing protein 88, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR88Q6ZMY6 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
WDR88Q6ZMY6 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
WDR88Q6ZMY6 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
WDR88Q6ZMY6 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
WDR88Q6ZMY6 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
WDR88Q6ZMY6 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
WDR88Q6ZMY6 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
WDR88Q6ZMY6 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
WDR88Q6ZMY6 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
WDR88Q6ZMY6 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
WDR88Q6ZMY6 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
WDR88Q6ZMY6 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
WDR88Q6ZMY6 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
WDR88Q6ZMY6 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
WDR88Q6ZMY6 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
WDR88Q6ZMY6 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
WDR88Q6ZMY6 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
WDR88Q6ZMY6 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
WDR88Q6ZMY6 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
WDR88Q6ZMY6 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
WDR88Q6ZMY6 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
WDR88Q6ZMY6 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
WDR88Q6ZMY6 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
WDR88Q6ZMY6 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
WDR88Q6ZMY6 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
WDR88Q6ZMY6 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
WDR88Q6ZMY6 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
WDR88Q6ZMY6 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
WDR88Q6ZMY6 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
WDR88Q6ZMY6 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
WDR88Q6ZMY6 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
WDR88Q6ZMY6 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
WDR88Q6ZMY6 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
WDR88Q6ZMY6 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
WDR88Q6ZMY6 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
WDR88Q6ZMY6 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
WDR88Q6ZMY6 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
WDR88Q6ZMY6 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
WDR88Q6ZMY6 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
WDR88Q6ZMY6 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
WDR88Q6ZMY6 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
WDR88Q6ZMY6 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
WDR88Q6ZMY6 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
WDR88Q6ZMY6 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
WDR88Q6ZMY6 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
WDR88Q6ZMY6 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
WDR88Q6ZMY6 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
WDR88Q6ZMY6 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
WDR88Q6ZMY6 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
WDR88Q6ZMY6 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
WDR88Q6ZMY6 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
WDR88Q6ZMY6 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
WDR88Q6ZMY6 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
WDR88Q6ZMY6 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
WDR88Q6ZMY6 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
WDR88Q6ZMY6 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
WDR88Q6ZMY6 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
WDR88Q6ZMY6 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
WDR88Q6ZMY6 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
WDR88Q6ZMY6 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
WDR88Q6ZMY6 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
WDR88Q6ZMY6 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
WDR88Q6ZMY6 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
WDR88Q6ZMY6 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
WDR88Q6ZMY6 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
WDR88Q6ZMY6 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
WDR88Q6ZMY6 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
WDR88Q6ZMY6 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
WDR88Q6ZMY6 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
WDR88Q6ZMY6 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
WDR88Q6ZMY6 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
WDR88Q6ZMY6 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
WDR88Q6ZMY6 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
WDR88Q6ZMY6 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
WDR88Q6ZMY6 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
WDR88Q6ZMY6 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
WDR88Q6ZMY6 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
WDR88Q6ZMY6 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
WDR88Q6ZMY6 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
WDR88Q6ZMY6 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
WDR88Q6ZMY6 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
WDR88Q6ZMY6 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
WDR88Q6ZMY6 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
WDR88Q6ZMY6 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
WDR88Q6ZMY6 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
WDR88Q6ZMY6 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC19.92■□□□□ 0.78
WDR88Q6ZMY6 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
WDR88Q6ZMY6 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
WDR88Q6ZMY6 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
WDR88Q6ZMY6 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
WDR88Q6ZMY6 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
WDR88Q6ZMY6 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
WDR88Q6ZMY6 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
WDR88Q6ZMY6 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
WDR88Q6ZMY6 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
WDR88Q6ZMY6 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
WDR88Q6ZMY6 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
WDR88Q6ZMY6 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
WDR88Q6ZMY6 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
WDR88Q6ZMY6 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms