Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWE0

LRSAM1, E3 ubiquitin-protein ligase LRSAM1, humanhuman

Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRSAM1Q6UWE0 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LRSAM1Q6UWE0 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
LRSAM1Q6UWE0 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
LRSAM1Q6UWE0 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LRSAM1Q6UWE0 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LRSAM1Q6UWE0 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LRSAM1Q6UWE0 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LRSAM1Q6UWE0 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LRSAM1Q6UWE0 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LRSAM1Q6UWE0 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LRSAM1Q6UWE0 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LRSAM1Q6UWE0 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LRSAM1Q6UWE0 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LRSAM1Q6UWE0 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LRSAM1Q6UWE0 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LRSAM1Q6UWE0 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LRSAM1Q6UWE0 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LRSAM1Q6UWE0 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LRSAM1Q6UWE0 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LRSAM1Q6UWE0 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LRSAM1Q6UWE0 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
LRSAM1Q6UWE0 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
LRSAM1Q6UWE0 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LRSAM1Q6UWE0 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LRSAM1Q6UWE0 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LRSAM1Q6UWE0 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
LRSAM1Q6UWE0 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRSAM1Q6UWE0 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRSAM1Q6UWE0 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRSAM1Q6UWE0 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRSAM1Q6UWE0 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRSAM1Q6UWE0 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRSAM1Q6UWE0 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRSAM1Q6UWE0 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRSAM1Q6UWE0 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRSAM1Q6UWE0 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRSAM1Q6UWE0 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRSAM1Q6UWE0 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRSAM1Q6UWE0 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRSAM1Q6UWE0 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRSAM1Q6UWE0 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRSAM1Q6UWE0 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRSAM1Q6UWE0 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRSAM1Q6UWE0 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRSAM1Q6UWE0 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
LRSAM1Q6UWE0 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRSAM1Q6UWE0 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRSAM1Q6UWE0 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRSAM1Q6UWE0 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRSAM1Q6UWE0 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRSAM1Q6UWE0 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRSAM1Q6UWE0 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
LRSAM1Q6UWE0 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRSAM1Q6UWE0 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRSAM1Q6UWE0 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
LRSAM1Q6UWE0 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LRSAM1Q6UWE0 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LRSAM1Q6UWE0 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LRSAM1Q6UWE0 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LRSAM1Q6UWE0 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LRSAM1Q6UWE0 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LRSAM1Q6UWE0 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LRSAM1Q6UWE0 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LRSAM1Q6UWE0 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LRSAM1Q6UWE0 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LRSAM1Q6UWE0 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LRSAM1Q6UWE0 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LRSAM1Q6UWE0 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LRSAM1Q6UWE0 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LRSAM1Q6UWE0 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LRSAM1Q6UWE0 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
LRSAM1Q6UWE0 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
LRSAM1Q6UWE0 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LRSAM1Q6UWE0 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LRSAM1Q6UWE0 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LRSAM1Q6UWE0 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LRSAM1Q6UWE0 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LRSAM1Q6UWE0 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LRSAM1Q6UWE0 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LRSAM1Q6UWE0 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LRSAM1Q6UWE0 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LRSAM1Q6UWE0 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
LRSAM1Q6UWE0 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LRSAM1Q6UWE0 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
LRSAM1Q6UWE0 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRSAM1Q6UWE0 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRSAM1Q6UWE0 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRSAM1Q6UWE0 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRSAM1Q6UWE0 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
LRSAM1Q6UWE0 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
LRSAM1Q6UWE0 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRSAM1Q6UWE0 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRSAM1Q6UWE0 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRSAM1Q6UWE0 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRSAM1Q6UWE0 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LRSAM1Q6UWE0 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LRSAM1Q6UWE0 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LRSAM1Q6UWE0 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LRSAM1Q6UWE0 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LRSAM1Q6UWE0 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms