Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDKN3Q16667 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDKN3Q16667 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDKN3Q16667 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDKN3Q16667 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDKN3Q16667 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDKN3Q16667 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDKN3Q16667 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDKN3Q16667 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDKN3Q16667 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDKN3Q16667 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDKN3Q16667 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDKN3Q16667 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDKN3Q16667 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDKN3Q16667 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CDKN3Q16667 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDKN3Q16667 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CDKN3Q16667 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDKN3Q16667 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CDKN3Q16667 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDKN3Q16667 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDKN3Q16667 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDKN3Q16667 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
CDKN3Q16667 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDKN3Q16667 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDKN3Q16667 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDKN3Q16667 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDKN3Q16667 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDKN3Q16667 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDKN3Q16667 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDKN3Q16667 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CDKN3Q16667 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDKN3Q16667 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDKN3Q16667 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDKN3Q16667 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDKN3Q16667 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDKN3Q16667 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CDKN3Q16667 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CDKN3Q16667 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDKN3Q16667 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDKN3Q16667 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDKN3Q16667 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDKN3Q16667 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDKN3Q16667 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDKN3Q16667 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CDKN3Q16667 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CDKN3Q16667 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CDKN3Q16667 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CDKN3Q16667 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CDKN3Q16667 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CDKN3Q16667 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CDKN3Q16667 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CDKN3Q16667 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CDKN3Q16667 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CDKN3Q16667 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CDKN3Q16667 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDKN3Q16667 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDKN3Q16667 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDKN3Q16667 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDKN3Q16667 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDKN3Q16667 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDKN3Q16667 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDKN3Q16667 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDKN3Q16667 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDKN3Q16667 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDKN3Q16667 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CDKN3Q16667 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CDKN3Q16667 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDKN3Q16667 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDKN3Q16667 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDKN3Q16667 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDKN3Q16667 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDKN3Q16667 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDKN3Q16667 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDKN3Q16667 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDKN3Q16667 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDKN3Q16667 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDKN3Q16667 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDKN3Q16667 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDKN3Q16667 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDKN3Q16667 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDKN3Q16667 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CDKN3Q16667 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CDKN3Q16667 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CDKN3Q16667 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CDKN3Q16667 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CDKN3Q16667 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDKN3Q16667 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDKN3Q16667 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDKN3Q16667 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDKN3Q16667 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDKN3Q16667 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDKN3Q16667 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDKN3Q16667 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDKN3Q16667 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDKN3Q16667 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDKN3Q16667 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDKN3Q16667 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDKN3Q16667 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDKN3Q16667 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.8 ms