Protein–RNA interactions for Protein: Q14112

NID2, Nidogen-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NID2Q14112 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NID2Q14112 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NID2Q14112 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NID2Q14112 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
NID2Q14112 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.67
NID2Q14112 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
NID2Q14112 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
NID2Q14112 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
NID2Q14112 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NID2Q14112 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NID2Q14112 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NID2Q14112 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NID2Q14112 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NID2Q14112 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NID2Q14112 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
NID2Q14112 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NID2Q14112 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NID2Q14112 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NID2Q14112 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NID2Q14112 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NID2Q14112 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NID2Q14112 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NID2Q14112 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NID2Q14112 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NID2Q14112 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NID2Q14112 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NID2Q14112 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NID2Q14112 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NID2Q14112 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NID2Q14112 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NID2Q14112 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NID2Q14112 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NID2Q14112 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NID2Q14112 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NID2Q14112 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NID2Q14112 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NID2Q14112 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NID2Q14112 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NID2Q14112 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NID2Q14112 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NID2Q14112 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NID2Q14112 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
NID2Q14112 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NID2Q14112 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NID2Q14112 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NID2Q14112 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NID2Q14112 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NID2Q14112 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NID2Q14112 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NID2Q14112 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NID2Q14112 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NID2Q14112 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NID2Q14112 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NID2Q14112 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NID2Q14112 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NID2Q14112 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NID2Q14112 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NID2Q14112 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NID2Q14112 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NID2Q14112 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NID2Q14112 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
NID2Q14112 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
NID2Q14112 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NID2Q14112 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NID2Q14112 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NID2Q14112 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NID2Q14112 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NID2Q14112 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NID2Q14112 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NID2Q14112 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
NID2Q14112 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
NID2Q14112 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NID2Q14112 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NID2Q14112 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
NID2Q14112 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
NID2Q14112 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
NID2Q14112 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NID2Q14112 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
NID2Q14112 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NID2Q14112 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NID2Q14112 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NID2Q14112 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
NID2Q14112 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NID2Q14112 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
NID2Q14112 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NID2Q14112 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NID2Q14112 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NID2Q14112 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NID2Q14112 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NID2Q14112 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
NID2Q14112 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NID2Q14112 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NID2Q14112 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NID2Q14112 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NID2Q14112 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NID2Q14112 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NID2Q14112 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NID2Q14112 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NID2Q14112 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NID2Q14112 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
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