Protein–RNA interactions for Protein: Q05C16

LRRC63, Leucine-rich repeat-containing protein 63, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC63Q05C16 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
LRRC63Q05C16 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRC63Q05C16 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRC63Q05C16 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRC63Q05C16 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRC63Q05C16 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRC63Q05C16 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRC63Q05C16 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRC63Q05C16 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRC63Q05C16 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRC63Q05C16 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRC63Q05C16 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRC63Q05C16 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRC63Q05C16 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRC63Q05C16 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRC63Q05C16 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRC63Q05C16 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRC63Q05C16 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRC63Q05C16 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRC63Q05C16 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRC63Q05C16 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRC63Q05C16 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRC63Q05C16 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRC63Q05C16 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRC63Q05C16 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRC63Q05C16 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRC63Q05C16 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRC63Q05C16 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRC63Q05C16 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRC63Q05C16 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRC63Q05C16 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRC63Q05C16 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRC63Q05C16 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRC63Q05C16 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRC63Q05C16 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRC63Q05C16 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRC63Q05C16 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRC63Q05C16 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRC63Q05C16 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRRC63Q05C16 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRRC63Q05C16 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRRC63Q05C16 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRRC63Q05C16 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRRC63Q05C16 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRRC63Q05C16 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRRC63Q05C16 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRRC63Q05C16 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRRC63Q05C16 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRRC63Q05C16 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRRC63Q05C16 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRRC63Q05C16 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRRC63Q05C16 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRRC63Q05C16 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRRC63Q05C16 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRRC63Q05C16 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRRC63Q05C16 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRRC63Q05C16 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRRC63Q05C16 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRRC63Q05C16 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRRC63Q05C16 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
LRRC63Q05C16 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRRC63Q05C16 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRRC63Q05C16 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
LRRC63Q05C16 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRRC63Q05C16 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRRC63Q05C16 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRRC63Q05C16 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRRC63Q05C16 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRRC63Q05C16 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRRC63Q05C16 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRRC63Q05C16 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRRC63Q05C16 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRRC63Q05C16 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRRC63Q05C16 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRRC63Q05C16 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRRC63Q05C16 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRRC63Q05C16 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRRC63Q05C16 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRRC63Q05C16 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRRC63Q05C16 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRRC63Q05C16 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRRC63Q05C16 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRRC63Q05C16 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
LRRC63Q05C16 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRRC63Q05C16 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRRC63Q05C16 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRRC63Q05C16 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRRC63Q05C16 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRRC63Q05C16 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRRC63Q05C16 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRRC63Q05C16 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRRC63Q05C16 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRRC63Q05C16 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRRC63Q05C16 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRRC63Q05C16 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRRC63Q05C16 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRRC63Q05C16 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRRC63Q05C16 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRRC63Q05C16 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRRC63Q05C16 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.9 ms