Protein–RNA interactions for Protein: P98173

FAM3A, Protein FAM3A, humanhuman

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Length 230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3AP98173 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
FAM3AP98173 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
FAM3AP98173 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
FAM3AP98173 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FAM3AP98173 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FAM3AP98173 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
FAM3AP98173 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FAM3AP98173 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FAM3AP98173 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FAM3AP98173 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FAM3AP98173 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
FAM3AP98173 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
FAM3AP98173 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
FAM3AP98173 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
FAM3AP98173 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FAM3AP98173 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FAM3AP98173 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
FAM3AP98173 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
FAM3AP98173 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FAM3AP98173 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FAM3AP98173 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FAM3AP98173 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
FAM3AP98173 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FAM3AP98173 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FAM3AP98173 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
FAM3AP98173 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FAM3AP98173 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FAM3AP98173 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FAM3AP98173 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FAM3AP98173 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FAM3AP98173 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
FAM3AP98173 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
FAM3AP98173 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
FAM3AP98173 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
FAM3AP98173 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
FAM3AP98173 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FAM3AP98173 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
FAM3AP98173 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
FAM3AP98173 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FAM3AP98173 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
FAM3AP98173 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
FAM3AP98173 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
FAM3AP98173 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FAM3AP98173 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
FAM3AP98173 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
FAM3AP98173 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
FAM3AP98173 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FAM3AP98173 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
FAM3AP98173 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
FAM3AP98173 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
FAM3AP98173 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
FAM3AP98173 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FAM3AP98173 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
FAM3AP98173 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FAM3AP98173 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FAM3AP98173 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
FAM3AP98173 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
FAM3AP98173 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FAM3AP98173 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FAM3AP98173 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
FAM3AP98173 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
FAM3AP98173 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
FAM3AP98173 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
FAM3AP98173 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FAM3AP98173 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FAM3AP98173 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FAM3AP98173 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
FAM3AP98173 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
FAM3AP98173 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
FAM3AP98173 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
FAM3AP98173 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
FAM3AP98173 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
FAM3AP98173 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FAM3AP98173 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FAM3AP98173 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FAM3AP98173 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FAM3AP98173 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
FAM3AP98173 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
FAM3AP98173 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FAM3AP98173 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
FAM3AP98173 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FAM3AP98173 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FAM3AP98173 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FAM3AP98173 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FAM3AP98173 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FAM3AP98173 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
FAM3AP98173 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FAM3AP98173 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
FAM3AP98173 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FAM3AP98173 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FAM3AP98173 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FAM3AP98173 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FAM3AP98173 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
FAM3AP98173 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FAM3AP98173 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
FAM3AP98173 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FAM3AP98173 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
FAM3AP98173 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FAM3AP98173 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
FAM3AP98173 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
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