Protein–RNA interactions for Protein: P78411

IRX5, Iroquois-class homeodomain protein IRX-5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 483 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX5P78411 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
IRX5P78411 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
IRX5P78411 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC25■■□□□ 1.59
IRX5P78411 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
IRX5P78411 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
IRX5P78411 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
IRX5P78411 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
IRX5P78411 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
IRX5P78411 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
IRX5P78411 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
IRX5P78411 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
IRX5P78411 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
IRX5P78411 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
IRX5P78411 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
IRX5P78411 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
IRX5P78411 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
IRX5P78411 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
IRX5P78411 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
IRX5P78411 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
IRX5P78411 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
IRX5P78411 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
IRX5P78411 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
IRX5P78411 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
IRX5P78411 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
IRX5P78411 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
IRX5P78411 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
IRX5P78411 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
IRX5P78411 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
IRX5P78411 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
IRX5P78411 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
IRX5P78411 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
IRX5P78411 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
IRX5P78411 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
IRX5P78411 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
IRX5P78411 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
IRX5P78411 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
IRX5P78411 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
IRX5P78411 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
IRX5P78411 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
IRX5P78411 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
IRX5P78411 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
IRX5P78411 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
IRX5P78411 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
IRX5P78411 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
IRX5P78411 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
IRX5P78411 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
IRX5P78411 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
IRX5P78411 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
IRX5P78411 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
IRX5P78411 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
IRX5P78411 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
IRX5P78411 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
IRX5P78411 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
IRX5P78411 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
IRX5P78411 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
IRX5P78411 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
IRX5P78411 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
IRX5P78411 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
IRX5P78411 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
IRX5P78411 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
IRX5P78411 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
IRX5P78411 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
IRX5P78411 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
IRX5P78411 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
IRX5P78411 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
IRX5P78411 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
IRX5P78411 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
IRX5P78411 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
IRX5P78411 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
IRX5P78411 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
IRX5P78411 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
IRX5P78411 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
IRX5P78411 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
IRX5P78411 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
IRX5P78411 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
IRX5P78411 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
IRX5P78411 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
IRX5P78411 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
IRX5P78411 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
IRX5P78411 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
IRX5P78411 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
IRX5P78411 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
IRX5P78411 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
IRX5P78411 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
IRX5P78411 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
IRX5P78411 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
IRX5P78411 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
IRX5P78411 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
IRX5P78411 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
IRX5P78411 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
IRX5P78411 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
IRX5P78411 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
IRX5P78411 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
IRX5P78411 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
IRX5P78411 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
IRX5P78411 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
IRX5P78411 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
IRX5P78411 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
IRX5P78411 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
IRX5P78411 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.4 ms